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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001005`

染色体: Chr05 坐标: 8218295-8220909 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001005`
名称	SmilChr05G001005
描述	alpha-farnesene synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8218295 - 8220909 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985718`
GeneID	`130985718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985718`
原始查询	`LOC130985718`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-farnesene synthase-like
产物	alpha-farnesene synthase-like
Arabidopsis	`AT4G16740` (TPS03) terpene synthase 03 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827377] identity=35; qcov=1.06; evalue=7.48e-106; confidence=low
Rice	`Os03g0347900` - identity=29.9; qcov=0.977; evalue=1.31e-53; confidence=low
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG	smil00909 (Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764792.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057764792.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764792.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057764792.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8220122`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B79
`Chr5:8220122`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B79
`Chr5:8220553`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,B109,B114,B72,C41,C49,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764792.1

527 aa

264

527

Terpene_synth

Terpene_synth_C

Terpene_syn_C_2

PF01397 Terpene_synth 21-167 aa PF03936 Terpene_synth_C 230-467 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 269-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764792.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	21	167	1.2e-23	84.5	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057764792.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	230	467	1.8e-80	270.5	Terpene synthase family, metal binding domain
`XP_057764792.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	269	467	3.8e-51	174.4	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908809.1
GAGGAATCTACATATACATCTTGCGGTCCAAAGTAGAATTAATTAATTAAGGTAGTGATCCAGATGAATATAGGATCTGCAGCTGCGACTCTTCCCAGGCGGACAGCCAATTACAAGCCCAACATATGGAATTACGACCACTTGCATTCGCTTACTACTAAATACCATGAAGAGTTGGAGGAGCACTTACGTGAAGCTGAGACACTGAAAGACCAAGTTTGCAGCGAGTTTGGTGTGTTGAAAGATCCATTGCAGAAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985718
ATGAATATAGGATCTGCAGCTGCGACTCTTCCCAGGCGGACAGCCAATTACAAGCCCAACATATGGAATTACGACCACTTGCATTCGCTTACTACTAAATACCATGAAGAGTTGGAGGAGCACTTACGTGAAGCTGAGACACTGAAAGACCAAGTTTGCAGCGAGTTTGGTGTGTTGAAAGATCCATTGCAGAAGCTGGAGCTCATAGATTGGATTGATAAACTGGCTCTTTCCCATTACTTTGAGGAAGAAATCAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764792.1
MNIGSAAATLPRRTANYKPNIWNYDHLHSLTTKYHEELEEHLREAETLKDQVCSEFGVLKDPLQKLELIDWIDKLALSHYFEEEISKSVKEMAYAHSTSLSMDAHLYSAALYFRILRQHGYHVSQDGILELLDGEEKLVAQWDDEKARVEIFEASHLGVEGECTFDQKLNDDVGKNKYSCHRNVRWFNVRRYMHEINNKSVIHRLAGLSFNTIQVQHQNDLKDILRWWRNLGLLEVLTFSRDRVVESFLWAVGVAYEPQH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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