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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001022`

染色体: Chr05 坐标: 8388472-8393869 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001022`
名称	SmilChr05G001022
描述	probable UDP-3-O-acylglucosamine N-acyltransferase 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8388472 - 8393869 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985734`
GeneID	`130985734`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985734`
原始查询	`LOC130985734`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable UDP-3-O-acylglucosamine N-acyltransferase 2, mitochondrial
产物	probable UDP-3-O-acylglucosamine N-acyltransferase 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G05210` (LpxD1) Trimeric LpxA-like enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825869] identity=67.4; qcov=0.813; evalue=2.67e-119; confidence=high
Rice	`Os07g0134400` - identity=59.2; qcov=0.35; evalue=7.97e-34; confidence=low
GO	GO:0009245 (lipid A biosynthetic process); GO:0016410 (GO:0016410)
KEGG	smil00540 (Lipopolysaccharide biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00132 (Hexapep)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985734

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764817.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057764817.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764817.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764817.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8389311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:8389334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:8390569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C26
`Chr5:8390925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B111,B94,C64,C7
`Chr5:8390941`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A2,B104,B111,B12,B124,B13,B4,B49,B67,B76,B79,B91,B94,C10,C19,C36,C39,C52,C57,C64,C79,D10
`Chr5:8390943`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A2,B104,B111,B12,B124,B13,B4,B49,B67,B76,B79,B91,B94,C10,C19,C36,C39,C52,C57,C64,C79,D10
`Chr5:8391104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C39
`Chr5:8391155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C25,C53
`Chr5:8393187`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A1,A2,A5,B111,B12,B124,B13,B2,B35,B4,B49,B67,B76,B91,B94,C10,C3,C36,C52,C57,C64,C66,C7,C79,D1,D10,D8
`Chr5:8393218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B138,B29,B33
`Chr5:8393403`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B111,C64
`Chr5:8393403`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B111,C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764817.1

294 aa

147

294

Hexapep

PF00132 Hexapep 181-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764817.1`	Pfam	`PF00132`	Hexapep	Repeat	181	216	6.2e-23	80.2	Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908834.1
GATGCTCTAAACCTCATTTTTTTCCTTCGACGAAAAAATAATCTCAAATATTAGTAAAATAGTAGTTGATGAAAAAAAATTAACTATTTTAGTAGGACATTTGTTCTTCTGCAAATCAGCGGCCTGAAACAGTGAAGAAAGGGCTTGGCGGAATTCCTGTTGAACTGAATCTCCGCAACGAAATTAGGGTTTGCCACTGGCAATGCGCTTTGCCAAATTAATTGCTCTCTCAGAACCGAAAATCTCCGCATCAAGAGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985734
ATGCGCTTTGCCAAATTAATTGCTCTCTCAGAACCGAAAATCTCCGCATCAAGAGTCACGCTTCCTAAATCCAATGTGGCAGCTCTGGTATTCTCAAGACTCATTTCGACCAATTGCACCAGTCAACATACAGGTGAGGATGCCGAGATAGAATATCAAGATTTTCAGAAATGGTGCAATGGAGGAGGCTTGTTTCACAAATCTGCTTGTATTGATCCAAGTGCTAGAATAGAGGTCGGGGCACTGGTGCATTCAGAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764817.1
MRFAKLIALSEPKISASRVTLPKSNVAALVFSRLISTNCTSQHTGEDAEIEYQDFQKWCNGGGLFHKSACIDPSARIEVGALVHSESAVGANVYVGSGSVVGPAVTIGQSTRTGYNVVLSNCTIGDFCVIHHGVCIGQDGFGFFIDEQGLMVKKPQCLKARIGNYVEIGANTCIDRGSWRDTVIGDHTKIDNLVQIGHNVEIGKNCMLCGQVGVAGSVTIGDYVILGGRVSIKDHVCVASKVRLAANSCVTKNISEAGDY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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