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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002681`

染色体: Chr01 坐标: 45025964-45027697 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002681`
名称	SmilChr01G002681
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45025964 - 45027697 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985759`
GeneID	`130985759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985759`
原始查询	`LOC130985759`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
产物	loganic acid O-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G68040` (AT1G68040) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843132] identity=44.6; qcov=0.959; evalue=2.93e-93; confidence=medium
Rice	`Os01g0701700` - identity=34; qcov=1.02; evalue=3.22e-57; confidence=low
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985759

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764864.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764864.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764864.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764864.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45026127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B37,B79,B86
`Chr1:45026169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B23,B95,C37,C48
`Chr1:45026190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,D5
`Chr1:45026198`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A1,A15,A20,A24,A25,A4,B10,B102,B106,B107,B108,B110,B113,B117,B118,B124,B13,B131,B134,B137,B19,B2,B29,B31,B36,B47,B49,B5,B53,B55,B56,B57,B62,B71,B81,B85,B88,C10,C16,C22,C23,C25,C26,C28,C29,C32,C33,C35,C37,C5,C50,C62,C68,C71,C74,C78,C83,C86,D1,D2,D3,D9
`Chr1:45026303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:45026316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr1:45026328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:45026362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr1:45026387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B127,B44,C37
`Chr1:45026777`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C80,D5
`Chr1:45026777`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C80,D5
`Chr1:45026783`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B10,B12,B123,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764864.1

339 aa

170

339

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 4-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764864.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	4	326	2.9e-104	349.7	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908881.1
TGTAATTGACCTTCACTTCAATCGAAAGGATTAATTTCACTCATTTCAGGAAAAAGATAGTAAATCAATAGAGTACTAGTAAGTAGTAATGGCTTCTCCAATGAATGGTGGTGACGGCACGCATAGCTACAGCAAGAACTCCACTTTGCAGAGATGTGGTTTAAGTGCTGTGGAGGATGCAATAAAGGAGGCAGTGATGCAGAATGTGGAGACAGACAAGTTGTTATGTGGTTCGACCAGATTCGCCATCGCCGACTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985759
ATGGCTTCTCCAATGAATGGTGGTGACGGCACGCATAGCTACAGCAAGAACTCCACTTTGCAGAGATGTGGTTTAAGTGCTGTGGAGGATGCAATAAAGGAGGCAGTGATGCAGAATGTGGAGACAGACAAGTTGTTATGTGGTTCGACCAGATTCGCCATCGCCGACTTAGGATGCTCAGTGGGGCCCAACACATTCCACGCCGTTGAAACCATCATCGAAGCCGTGCAACACAAGTCGTCCACTAACAACCTCGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764864.1
MASPMNGGDGTHSYSKNSTLQRCGLSAVEDAIKEAVMQNVETDKLLCGSTRFAIADLGCSVGPNTFHAVETIIEAVQHKSSTNNLEFQVLFNDQIGNDFNTLFASLPQERNYFAAAVAGSFYGRLFPSSSIHIAYSSGALHWLSKLPEGLKVKDSPAWNAGRIHYSGASDAVVKAYAEQLEEDLENFLRCRAQEIVGGGMIVILVGGVSHANVQHRSTVLFTFVEAILIDMVKEGVLAQEVVDSFNIPIVYACINDVRRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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