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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001037`

染色体: Chr05 坐标: 8504049-8505320 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001037`
名称	SmilChr05G001037
描述	probable dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8504049 - 8505320 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985760`
GeneID	`130985760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985760`
原始查询	`LOC130985760`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 3
产物	probable dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 3
Arabidopsis	`AT1G61790` (AT1G61790) Oligosaccharyltransferase complex/magnesium transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842476] identity=50.2; qcov=0.904; evalue=3.94e-113; confidence=high
Rice	`Os03g0565100` (OST3) - identity=51.1; qcov=0.916; evalue=2.53e-117; confidence=high
GO	GO:0008250 (oligosaccharyltransferase complex); GO:0018279 (GO:0018279)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04756 (OST3_OST6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057764860.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057764860.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764860.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764860.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764860.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8504346`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D2
`Chr5:8504346`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D2
`Chr5:8504353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B125,B128,B77,C13
`Chr5:8504375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B140,B23
`Chr5:8504580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:8504596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C26
`Chr5:8504639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:8504684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B140,B23
`Chr5:8504951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B56,B96
`Chr5:8504993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D5
`Chr5:8505179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,C20,C5,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764860.1

344 aa

172

344

OST3_OST6

PF04756 OST3_OST6 35-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764860.1`	Pfam	`PF04756`	OST3_OST6	Family	35	332	9.7e-70	236.0	OST3 / OST6 family, transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908877.1
TCTTTTGGTAACAGAAACAGAGAAGAAAGGATCAAGGACAGAATTATATATATTCTCGAATTTATTTTAGTTGCTTTACACACAAAAACTAAATCGGAGCAATTTAGGAGTCTGACACAAATGGCTCCCCCTACAAACGGCGGCGACGGCTTGTTCCTTCTCCTCTTCCTCCTCTGTCTCTCGACACCGCGCGGGTCGTCCTCAAACTCCATTACCGCATCGCTCTCGGCCCTCCAGTCGTCCTCCTCCAGCGGCGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985760
ATGGCTCCCCCTACAAACGGCGGCGACGGCTTGTTCCTTCTCCTCTTCCTCCTCTGTCTCTCGACACCGCGCGGGTCGTCCTCAAACTCCATTACCGCATCGCTCTCGGCCCTCCAGTCGTCCTCCTCCAGCGGCGTCATCCGCCTGAACGACACCCTCCTCCGCCGCATCCACTCCCTCCCCTCTCCCCGGCCCTTCCACTTGGTCGTCTTCTTCGACGCGAAGAAGCTCCATTCGAGATCGGAGCTCGCCCTCCCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764860.1
MAPPTNGGDGLFLLLFLLCLSTPRGSSSNSITASLSALQSSSSSGVIRLNDTLLRRIHSLPSPRPFHLVVFFDAKKLHSRSELALPTLKSEFSLVSSSFLANNPDNKSRSLLFFFDVEVEESQATFALFDVNTLPHIRLVPSAAADLKSDSIKLDAAHFSSLVDAMGELIESETGISVGPINRPPVVSRTQMILVMVGAVIWAPYAVRKLASGKSMVHEKSTWMAGAVFVYFFSVSGTMFNIIRKAPMFIVDRRDGETVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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