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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001059`

染色体: Chr05 坐标: 8756644-8762198 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001059`
名称	SmilChr05G001059
描述	tobamovirus multiplication protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8756644 - 8762198 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985763`
GeneID	`130985763`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985763`
原始查询	`LOC130985763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tobamovirus multiplication protein 1-like
产物	tobamovirus multiplication protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G21790` (TOM1) tobamovirus multiplication 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828267] identity=79; qcov=0.935; evalue=3.05e-163; confidence=high
Rice	`Os07g0102400` - identity=75.6; qcov=0.928; evalue=6.44e-141; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06454 (THH1_TOM1-3_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985763

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057764865.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057764865.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057764865.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057764865.1`
5	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057764865.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8757062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:8757095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:8759404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B35,B82,C32,C68
`Chr5:8759702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:8760170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B76,C53
`Chr5:8760200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B12,B24
`Chr5:8761814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B76,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764865.1

291 aa

146

291

THH1_TOM1-3_dom

PF06454 THH1_TOM1-3_dom 21-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764865.1`	Pfam	`PF06454`	THH1_TOM1-3_dom	Domain	21	291	6.9e-139	462.6	THH1/TOM1/TOM3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908882.1
GGTACATATTGCAGTAGGTTTAGTCAATCCATAAAAAAACTAAGTGAAAAAGTAGATTCATTTATTTCTAAATTTAATTTAATTACTTTGGAATTTTCTTTTACTTCCAATTTTCTTAAAATTAAAAATCCCACTGCACGTTTCTTTCTTTCTATTTTTTTCAAGTTTTTTACTTCTTACAGTCACCTATCGTGATTTGATCTCTTCTGCTCTGATTGGAAATAATATTATTCAAGTAGGCAACAGCTAATCAATTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985763
ATGGCCAGAATGCTAATGAGCTTTCCGACCATCGACGCCGGCGTCGGAGTGCTGCCGGCCAACTGGTGGGATGAGATCAACGAGTCCGTCGAATGGCAAGACGGAATATTCTACTCTCTCTGCGCGGCCTATGCCCTCGTTTGCTCCGTTGCCCTTATTCAATTGATAAGAATTGAACTTAGGGTTCCTGAATATGGTTGGACCACGCAAAAGGTTTTCCACCTCATGAACTTTATAGTAAATGGAGTGCGTGCTATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764865.1
MARMLMSFPTIDAGVGVLPANWWDEINESVEWQDGIFYSLCAAYALVCSVALIQLIRIELRVPEYGWTTQKVFHLMNFIVNGVRAIVFGFHKNVFLLHPKALSLVLLESPGLLFFSTYTLLVLFWAEIYHQARSLPTDKLRICYFAINSGVYFVQACIWVYLWIDDNSTAEFVGKIFIAVVSFAAALGFLLYGGRLFIMLRRFPIESKGRRKKLYEVGSVTAICFTCFLIRCFVVMLSAFDLDASLDVLDHPVLNVIYYT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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