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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001075`

染色体: Chr05 坐标: 8939476-8940873 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001075`
名称	SmilChr05G001075
描述	protein S40-5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8939476 - 8940873 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985769`
GeneID	`130985769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985769`
原始查询	`LOC130985769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein S40-5-like
产物	protein S40-5-like
Arabidopsis	`AT1G11700` (AT1G11700) senescence regulator (Protein of unknown function, DUF584) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837714] identity=48.2; qcov=1.09; evalue=9.76e-46; confidence=medium
Rice	`Os07g0516300` (OsS40-15) - identity=54.3; qcov=0.465; evalue=1.42e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04520 (Senescence_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985769

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764872.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764872.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764872.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764872.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8939968`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B129
`Chr5:8939968`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B129
`Chr5:8939979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:8940153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D2
`Chr5:8940252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764872.1

202 aa

101

202

Senescence_reg

PF04520 Senescence_reg 29-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764872.1`	Pfam	`PF04520`	Senescence_reg	Family	29	200	4.4e-42	145.5	Senescence regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908889.1
ATTATGAAAAGATACATTTGTGCCTATATTCAAGAAATCCATGTACATGACAAGACAAGCTTTGTTCTAGTAACACGCACGTACGGAACACGCGCTTCGAAGTAGGTCATGGAAATTGTTCTTCGATTTTACAGTTTCGTAGCCATCTTCCCATTCTCAACAATCAACATGCTTCCCTTGTCCGTATTGGTGGCATTCGCGAAATTCAGACAAAATGAAACCCAGATTCAAATGAAATAAACGGCTGGGCCCCAAGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985769
ATGGCCAAGGGTCGGAAACTGAGCAGCAGCCGCAGCGAACGCTTTTTAGGAAGTTTCGGTGGGCAGGCGGCGGCGAGCTCTGCATCCGAGCTGAGAGAAGAAGACATCTGGTCGGTCGCCGATGACGCCGTCAACGGCGATGATCGCTACGCAAACGGAGACTGGGGCTCACGCGCGTCCGCCGACAGCAGTAGAAGCTTCGGCGGTTACAGGGGCCGCCGGCCCTCGCAGCGGTCCGACCACAACCAAGTCGGCGGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764872.1
MAKGRKLSSSRSERFLGSFGGQAAASSASELREEDIWSVADDAVNGDDRYANGDWGSRASADSSRSFGGYRGRRPSQRSDHNQVGGLSLAFDEPSSTASQRIIHQFRPQEGVAGSPRGRNMATSAPVNVPDWSKIYRVDSVESLHDSDDGLDDAELVPPHEYLAREYARSRNSVFEGVGRTLKGRDMSRVRDAVWSQTGFDG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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