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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001031`

染色体: Chr05 坐标: 8462732-8465309 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001031`
名称	SmilChr05G001031
描述	protein translation factor SUI1 homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8462732 - 8465309 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985773`
GeneID	`130985773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985773`
原始查询	`LOC130985773`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein translation factor SUI1 homolog 2-like
产物	protein translation factor SUI1 homolog 2-like
Arabidopsis	`AT1G54290` (AT1G54290) Translation initiation factor SUI1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841870] identity=87.6; qcov=1; evalue=3.63e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0794500` - identity=87; qcov=1.02; evalue=4.43e-72; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01253 (SUI1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764876.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764878.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764876.1`
4	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057764878.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057764878.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8464810`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A13,A16,B108,B112,B140,B23,B63,B74,B79,C35,C54,D11
`Chr5:8464920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764876.1

140 aa

140

SUI1

PF01253 SUI1 28-80 aa

XP_057764877.1

115 aa

115

SUI1

PF01253 SUI1 28-99 aa

XP_057764878.1

113 aa

113

SUI1

PF01253 SUI1 28-102 aa

XP_057764879.1

113 aa

113

SUI1

PF01253 SUI1 28-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764876.1`	Pfam	`PF01253`	SUI1	Domain	28	80	5.8e-23	81.9	Translation initiation factor SUI1
`XP_057764877.1`	Pfam	`PF01253`	SUI1	Domain	28	99	2.6e-26	92.6	Translation initiation factor SUI1
`XP_057764878.1`	Pfam	`PF01253`	SUI1	Domain	28	102	4.5e-27	95.0	Translation initiation factor SUI1
`XP_057764879.1`	Pfam	`PF01253`	SUI1	Domain	28	102	4.5e-27	95.0	Translation initiation factor SUI1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908895.1
TTGTTGAGCCCGATGTTGATTGAGGAGCACATTTCATCCTTATTTAGTAATTTTCAAATGAATTATTTGTTTTCCCAATGCTGCAACTGCGTTCCGTTCCCTTTAAATATCACATATAATGCATATAGACATATATATGTAGAAAGAGAGAGGAGAAAGATTGTCATTCCCCCTTCTATATCTCTCGCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGATATTTTTTGCCTCCGATTTTCTCTACCGAAACGTTTCCCTATCTGATA...

XM_057908893.1
TCATCCTTATTTAGTAATTTTCAAATGAATTATTTGTTTTCCCAATGCTGCAACTGCGTTCCGTTCCCTTTAAATATCACATATAATGCATATAGACATATATATGTAGAAAGAGAGAGGAGAAAGATTGTCATTCCCCCTTCTATATCTCTCGCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGATATTTTTTGCCTCCGATTTTCTCTACCGAAACGTTTCCCTATCTGATAGTGTTGGACTCGTTGAACTCTCCGTCAGTTAAG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130985773
ATGTCTGATTTTGAAGTCCAAATCCCTGGCTCCTTTGATCCTTTTGCCGAGGCAAAAGCCGAGAACTCGGGTGCAGGGTCAAAAGAATATGTGCATATTCGCGTCCAGCAACGCAATGGTAGGAAAAGCCTGACAACTGTCCAGGGTTTGAAGAAGGAGTTCAGCTATAACAAAATTCTCAAGGACCTGAAGAAGGAGTTTTGCTGCAATGGTACAGTAGTACAGGACCCTGAGCTAGGCCAGGTTATACAACTCCAAGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057764876.1
MSDFEVQIPGSFDPFAEAKAENSGAGSKEYVHIRVQQRNGRKSLTTVQGLKKEFSYNKILKDLKKEFCCNGTVVQDPELGQVSILYHICFCFYSFCFYPVMCGALQVIQLQGDQRKNVSTFLVQVSLYIFVSQNNTSYNV

XP_057764877.1
MSDFEVQIPGSFDPFAEAKAENSGAGSKEYVHIRVQQRNGRKSLTTVQGLKKEFSYNKILKDLKKEFCCNGTVVQDPELGQVIQLQGDQRKNVSTFLVQVSLYIFVSQNNTSYNV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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