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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001094`

染色体: Chr05 坐标: 9111897-9117989 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001094`
名称	SmilChr05G001094
描述	arogenate dehydratase/prephenate dehydratase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9111897 - 9117989 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985800`
GeneID	`130985800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985800`
原始查询	`LOC130985800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	arogenate dehydratase/prephenate dehydratase 1, chloroplastic
产物	arogenate dehydratase/prephenate dehydratase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G11790` (ADT1) arogenate dehydratase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837725] identity=70.3; qcov=0.87; evalue=2.85e-174; confidence=high
Rice	`Os03g0286200` - identity=63.2; qcov=0.781; evalue=4.87e-138; confidence=high
GO	GO:0004664 (prephenate dehydratase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009094 (L-phenylalanine biosynthetic process); GO:0009507 (chloroplast); GO:0047769 (arogenate dehydratase activity)
KEGG	smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00800 (PDT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764905.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057764905.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764905.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764905.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764905.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9112710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B24
`Chr5:9113869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B65
`Chr5:9114294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:9116615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr5:9116803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:9116946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:9116982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:9117616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A5,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764905.1

407 aa

204

407

PDT

PF00800 PDT 123-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764905.1`	Pfam	`PF00800`	PDT	Family	123	298	1.2e-59	201.8	Prephenate dehydratase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089092.1
AAATCCTCTTAGCTTTCTTAAAAATAAAAAAGACTTGTAACTTTTCAAAGCTTTCAGTCTCATTTTCCTTTATATAGTAGATGCATTGATTTTAATGGTTCTTATGTTCTCACGATAAGTGTGGTTCTCACTATAACCGCACTCTACTATTTGATAATTAAAGATATTATAGATTTAGAAACGATTATTTACTTAATAATTGAGGCGAATCGATGGTTAAGTTTATGTTTAGAGAAGAGTTGTGGGTGGTGTGTCTTCCT...

XM_057908922.1
AAATCCTCTTAGCTTTCTTAAAAATAAAAAAGACTTGTAACTTTTCAAAGCTTTCAGTCTCATTTTCCTTTATATAGTAGATGCATTGATTTTAATGGTTCTTATGTTCTCACGATAAGTGTGGTTCTCACTATAACCGCACTCTACTATTTGATAATTAAAGATATTATAGATTTAGAAACGATTATTTACTTAATAATTGAGGCGAATCGATGGTTAAGTTTATGTTTAGAGAAGAGTTGTGGGTGGTGTGTCTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985800
ATGAGTCTCGCTTCCTGTGAGTGTGTCATTCCGCATTGGGATTGGTGCAGCAAAAAATCATGGCCTTTTAAAGCCGCGCCTTTCTTGGGTTTGGGCGTTGATAGCAAGAAAACTGCCCCGAATTTTCAATTAGGATTTTCAGATTGGCGGCCTGCTTGCTTGAATTTCAAGATTCGGAGGGAATGGGAATGTTCGGCGCTGAGGCTGAGGGCAGTCACTCCTGTCGATGATGAGATCCCTTCAACTCCAGATGTTGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764905.1
MSLASCECVIPHWDWCSKKSWPFKAAPFLGLGVDSKKTAPNFQLGFSDWRPACLNFKIRREWECSALRLRAVTPVDDEIPSTPDVAQEPTQIAPSTQFHKDLNSLPKPLSASSPSSDGTKSRVAYQGIPGAYSEAAALKAFPESETVPCDEFEAVFKAVELWLVDKAVLPIENSVGGSIHRNYDLLLRHRLNIVGEVQLIVNHCLLGLPGVRKEELKHVLSHPQALEQCEMILNKLGVTRINAVDTAVAAQMVDSEGLRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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