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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001096`

染色体: Chr05 坐标: 9126013-9128618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001096`
名称	SmilChr05G001096
描述	5'-adenylylsulfate reductase 3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9126013 - 9128618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985803`
GeneID	`130985803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985803`
原始查询	`LOC130985803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	5'-adenylylsulfate reductase 3, chloroplastic-like
产物	5'-adenylylsulfate reductase 3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G21990` (APR3) APS reductase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828288] identity=72.8; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0509800` (OsAPRL1) - identity=75.7; qcov=0.82; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004604 (phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin) activity); GO:0019379 (GO:0019379)
KEGG	smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01320 (Sulfur cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF01507 (PAPS_reduct)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764913.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057764913.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764913.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764913.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764913.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9126384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:9126461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9126615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B24
`Chr5:9126673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9127438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:9127495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:9127637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:9127648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:9127711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B12,B24
`Chr5:9127859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9127936`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B31
`Chr5:9127936`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764913.1

467 aa

234

467

PAPS_reduct

Thioredoxin

PF01507 PAPS_reduct 122-302 aa PF00085 Thioredoxin 371-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764913.1`	Pfam	`PF01507`	PAPS_reduct	Domain	122	302	5.6e-49	167.2	Phosphoadenosine phosphosulfate reductase domain
`XP_057764913.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	371	464	1.3e-09	38.7	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908930.1
GTGCTGACTCCCAACCTCAATAACAATCAGCTTCTACCCAAAAACACGTCCACATTCAATGAACCTGCCTTCCTTCCCATGTCCCCATCCTTATAAAAACCACCATTTACACCGCATTCCAAACAAAGATTTTCGCACTTATTCTCCGAAAACCCAGAACCCAAATTAGACAAATTAGATTTTCGCACTTATACGACCATGGCATCTGCTGTCACATCTTCTTCAGCTCTTTACAGTTCTTCTTTATCTTCTTCAATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985803
ATGGCATCTGCTGTCACATCTTCTTCAGCTCTTTACAGTTCTTCTTTATCTTCTTCAATTGACGAAGCCAAAGCCGCGCATTTAGGTGCATTTCAGCCGTTGGATAGGCTCCATTCCAGAACAACGGCCGTGAGTTTCGCAAGGAGGCGTGGCTCCGTGAAACCGTTGAATGCCGAACTGAAGAGGAATTACTCAATTATCCCTGCAGCGGCAACCGCGTCCGCTCCTGGTCTATTGAACACAGAAGAGGTTACCGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764913.1
MASAVTSSSALYSSSLSSSIDEAKAAHLGAFQPLDRLHSRTTAVSFARRRGSVKPLNAELKRNYSIIPAAATASAPGLLNTEEVTGGGNVEVEDYEKLARELENASPLEIMDKALEKFGNDIAIAFSGAEDVALIEYARLTGRPFRVFSLDTGRLNPETYKFFDEVEKHYGIRIEYMFPDAAEVQDLVRRKGLFSFYEDGHQECCRVRKVRPLRRALKGLRAWITGQRKDQSPGTRSEIPVVQVDPVFEGLDGGVGSLVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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