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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001104`

染色体: Chr05 坐标: 9172547-9175840 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001104`
名称	SmilChr05G001104
描述	aminomethyltransferase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9172547 - 9175840 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985809`
GeneID	`130985809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985809`
原始查询	`LOC130985809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aminomethyltransferase, mitochondrial
产物	aminomethyltransferase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G11860` (AT1G11860) Glycine cleavage T-protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837733] identity=89; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0623800` (Amt) - identity=84.2; qcov=0.914; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004047 (aminomethyltransferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0019464 (glycine decarboxylation via glycine cleavage system)
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00670 (One carbon pool by folate - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00785 (Lipoic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01571 (GCV_T); PF08669 (GCV_T_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764926.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057764926.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764926.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764926.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764926.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9173537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B80
`Chr5:9173736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C23,C85
`Chr5:9173745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:9174550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:9174566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:9175240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B42,B43,B62
`Chr5:9175483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9175615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764926.1

408 aa

204

408

GCV_T

GCV_T_C

PF01571 GCV_T 41-299 aa PF08669 GCV_T_C 327-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764926.1`	Pfam	`PF01571`	GCV_T	Domain	41	299	3.4e-72	243.4	GCVT N-terminal domain
`XP_057764926.1`	Pfam	`PF08669`	GCV_T_C	Domain	327	400	5.2e-18	65.4	Glycine cleavage T-protein C-terminal barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908943.1
TATAAACACAAATCGTGATACAAATTTACTGTGCATATGTATTTTAGTTCCAACAAAAATACATTATACAATAGGAAGGTGGCATCAGCTACCAAAGAAGCTGACAAAGTGGGAAAGGGTAATTGAATATCGTATCACCACTCACTCAAGATGGGTCTTGATCTCTGCTGAGAAAGCCTCCTCCACCCACTAAATCCATTATTTATTTTCCTTCTTTTACCAATTTCCGATAAAATTAAACATTATTATTTCGACCCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985809
ATGAGGGGAGGGGGATTGTGGCAACTTGGTCAATCAGTTACGCGCCGCTTGGCTCAGGCTGATAAGAAAACGGTTGCACGTCGATGCTTTGCATCAGAGGCTGACCTTAAGAAGACAGTTCTGTATGACTTCCATGTCGCCCATGGCGGAAAGATGGTCCCTTTTGCAGGCTGGAGCATGCCCATTCAGTACAAAGACTCGATTATGGACTCAACGTTGAACTGCAGGGAGAATGGCAGCCTCTTTGACGTTTCGCATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764926.1
MRGGGLWQLGQSVTRRLAQADKKTVARRCFASEADLKKTVLYDFHVAHGGKMVPFAGWSMPIQYKDSIMDSTLNCRENGSLFDVSHMCGLSLKGKDCIPFLEKLVVADVAGLAPGTGTLTVFTNEKGGAIDDSVITKVTNEHIYLVVNAGCRDKDLAHIEEHMKAFTSKGGDVSWHIHDERSLLALQGPLAAPVLQHLTKEDLSKLYFGEFQVLDINGALCFLTRTGYTGEDGFEISVPSENAVDLAKAILEKSEGKVRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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