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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001103`

染色体: Chr05 坐标: 9170156-9172323 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001103`
名称	SmilChr05G001103
描述	uncharacterized SmilChr05G001103
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9170156 - 9172323 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985810`
GeneID	`130985810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985810`
原始查询	`LOC130985810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBb0036F07.14; symbol=OSJNBb0036F07.14; hit=Os03g0744700; species=rice; confidence=high
产物	OSJNBb0036F07.14; symbol=OSJNBb0036F07.14; hit=Os03g0744700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G62250` (AT1G62250) orotidine 5'-phosphate decarboxylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842522] identity=69.5; qcov=0.869; evalue=1.84e-108; confidence=high
Rice	`Os03g0744700` (OSJNBb0036F07.14) - identity=67.6; qcov=0.854; evalue=1.95e-109; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25286 (DUF7876)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764927.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057764927.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057764930.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764927.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9170377`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	102	A13,A14,A15,A21,A22,A23,A24,A25,A6,A7,A9,B100,B101,B103,B105,B107,B11,B115,B118,B120,B122,B123,B127,B128,B133,B139,B15,B16,B19,B20,B22,B28,B32,B33,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B5,B53,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B67,B68,B69,B70,B74,B81,B83,B90,B91,B92,B93,B97,B98,C1,C10,C13,C14,C15,C21,C24,C30,C33,C36,C39,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C52,C55,C57,C58,C6,C60,C61,C64,C66,C67,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C84,C85,D1,D2,D4,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764927.1

299 aa

150

299

DUF7876

PF25286 DUF7876 69-252 aa

XP_057764929.1

299 aa

150

299

DUF7876

PF25286 DUF7876 69-252 aa

XP_057764930.1

260 aa

130

260

DUF7876

PF25286 DUF7876 69-258 aa

XP_057764931.1

260 aa

130

260

DUF7876

PF25286 DUF7876 69-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764927.1`	Pfam	`PF25286`	DUF7876	Domain	69	252	1.5e-100	335.1	Domain of unknown function (DUF7876)
`XP_057764929.1`	Pfam	`PF25286`	DUF7876	Domain	69	252	1.5e-100	335.1	Domain of unknown function (DUF7876)
`XP_057764930.1`	Pfam	`PF25286`	DUF7876	Domain	69	258	3.5e-106	353.5	Domain of unknown function (DUF7876)
`XP_057764931.1`	Pfam	`PF25286`	DUF7876	Domain	69	258	3.5e-106	353.5	Domain of unknown function (DUF7876)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908948.1
GTTGGAGAAACTGAACTGAAAGAGACTGCGGTGATTGCTGAAAAATTGAGACATACTAATTGTCTAAAATAAAAAACATTGAGGGACCAAAATGAGATTGTTTGAAAACATAAGGGTCGTTGGGATAATTCCGCCGAACGACGTCGGATGACTCTGGTTTTCGGAAGCTCAAAGTCCAAAACGCCAGGAGCCAGAAAAATCGAATGCGTGTGATTTTCAAAGTTCTGTGAATTCATAATTAAATCTCCGGAGCCATTCAC...

XM_057908947.1
GAGATTGTTTGAAAACATAAGGGTCGTTGGGATAATTCCGCCGAACGACGTCGGATGACTCTGGTTTTCGGAAGCTCAAAGTCCAAAACGCCAGGAGCCAGAAAAATCGAATGCGTGTGATTTTCAAAGTTCTGTGAATTCATAATTAAATCTCCGGAGCCATTCACCAAAATCAAATTTCTGTCAGATTCTTCTCTTATATCTCCATATCCACTTAGTCCAACAACCATTTCTTGATCTTTTTTGCTTTCTCCTTGGTG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130985810
ATGTTGACGACGATAACCTTCAACAGTTGCCAACCACATATGGAAATGCAAGAACCTACTAATTCCAAGTTGATTCATGCTTGCAATTCCAAGTTTCACAAGGGATATTGGTCCAACTTGTCTTGTTCTCAAAATTTCAGTAATCAGCTCAAACTTCAAAGTTTCTCCCACCAAACAACTTCAAGGAGGTGGCTGTGCCGCTCTCAAGATTCTCTCTCTCCAGAAAATGAGTATCGGTCATCGCGTAACATAGCAATCAG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057764927.1
MLTTITFNSCQPHMEMQEPTNSKLIHACNSKFHKGYWSNLSCSQNFSNQLKLQSFSHQTTSRRWLCRSQDSLSPENEYRSSRNIAISLLRRYRNFVERGGGDNLKEFISAGVNAYELGCTDEGLRKELTDMKESGVEIEAMQTYGGNTGLKSNIISQEVDECIMWLSIVFITILCTPQPTVVRWSSSPPVSEEMLMYWKGFCAIIANAYYMRGMAWLPVKTLQLEQMAVMGRAEEPSLVASRMRLVFSTLEVGWHISTSQ...

XP_057764929.1
MLTTITFNSCQPHMEMQEPTNSKLIHACNSKFHKGYWSNLSCSQNFSNQLKLQSFSHQTTSRRWLCRSQDSLSPENEYRSSRNIAISLLRRYRNFVERGGGDNLKEFISAGVNAYELGCTDEGLRKELTDMKESGVEIEAMQTYGGNTGLKSNIISQEVDECIMWLSIVFITILCTPQPTVVRWSSSPPVSEEMLMYWKGFCAIIANAYYMRGMAWLPVKTLQLEQMAVMGRAEEPSLVASRMRLVFSTLEVGWHISTSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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