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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001107`

染色体: Chr05 坐标: 9186001-9187425 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001107`
名称	SmilChr05G001107
描述	probable F-box protein At4g22030
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9186001 - 9187425 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985813`
GeneID	`130985813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985813`
原始查询	`LOC130985813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable F-box protein At4g22030
产物	probable F-box protein At4g22030
Arabidopsis	`AT4G22030` (AT4G22030) F-box protein with a domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828292] identity=48.6; qcov=1.08; evalue=1.08e-124; confidence=high
Rice	`Os02g0225900` - identity=50; qcov=0.863; evalue=9.26e-86; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14476 (Chloroplast_duf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764935.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764935.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764935.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764935.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9186114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:9186159`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C64
`Chr5:9186159`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C64
`Chr5:9186231`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B1,B2
`Chr5:9186231`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:9186233`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B1,B2
`Chr5:9186233`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:9186271`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C7
`Chr5:9186271`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C7
`Chr5:9186273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr5:9186462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B55
`Chr5:9186516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,C5,D2,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764935.1

394 aa

197

394

Chloroplast_duf

PF14476 Chloroplast_duf 72-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764935.1`	Pfam	`PF14476`	Chloroplast_duf	Family	72	382	1.6e-151	504.5	Petal formation-expressed

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908952.1
TCCCTCGCCAATCTACTCACTTAATTCTTAACACATTACAATTTTCATAACTAACAAATACTCGTACACAAAAGGGAGTTAATGGCGACATTAATGTTGAATTCATCCATCTCCTACAAGCAAAGAGAAATAGTCAAGGCCGCCATCAACATCCCAAGGCGGGTCGCCAGAATCAAGATTCCGGGGCTCCGAACTGGAGGATTCCCGGAGCAAACGGAGAAGCCTCTCAAAATCATCACCCTCGTCGAAAACGGAAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985813
ATGGCGACATTAATGTTGAATTCATCCATCTCCTACAAGCAAAGAGAAATAGTCAAGGCCGCCATCAACATCCCAAGGCGGGTCGCCAGAATCAAGATTCCGGGGCTCCGAACTGGAGGATTCCCGGAGCAAACGGAGAAGCCTCTCAAAATCATCACCCTCGTCGAAAACGGAAACCCTAACCCTAACCAGCCGGATCCGACCGTGGTGGCGAAGCTTTACGCGATCATGGAAGCAGTCGCGGATCGAGTGGAGATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764935.1
MATLMLNSSISYKQREIVKAAINIPRRVARIKIPGLRTGGFPEQTEKPLKIITLVENGNPNPNQPDPTVVAKLYAIMEAVADRVEMHRNVGEQRDNWNSLLLTSINSMTLAAAAMAGIAAAAGGSPAAALKISSTVMYVAATCMLSVMNKIQPSQLAEEQRNGARLFKQLHNQIQTVISMGNPTAADVREMMERVLALDKAFPLPLLGAMLEKFPAAVEPAVSWPEQRRRKAISRGNAGYNGWNGKLEEEMRQVIRVVRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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