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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001114`

染色体: Chr05 坐标: 9290405-9291719 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001114`
名称	SmilChr05G001114
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9290405 - 9291719 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985821`
GeneID	`130985821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985821`
原始查询	`LOC130985821`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530-like
产物	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530-like
Arabidopsis	`AT3G25290` (AT3G25290) Auxin-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822123] identity=40.9; qcov=0.522; evalue=5.83e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0194900` - identity=35.2; qcov=0.798; evalue=8.03e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057764944.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057764944.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057764944.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057764946.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057764946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9290755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr5:9290883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:9290891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B88,C61
`Chr5:9291217`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A24,C42
`Chr5:9291217`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr5:9291367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr5:9291483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C4,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764944.1

222 aa

111

222

Cytochrom_B561

PF03188 Cytochrom_B561 64-191 aa

XP_057764946.1

178 aa

178

Cytochrom_B561

PF03188 Cytochrom_B561 64-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764944.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	64	191	9.7e-11	42.8	Eukaryotic cytochrome b561
`XP_057764946.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	64	149	3.2e-06	28.1	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908963.1
TCAGACAGCATTATGAGCTAAATGATTGGCTGACAAACATCTTCACTCTCTTACAAGCAAAGGATATATTCTTGTACGACTAATTTTATTCGAACCGACCATAGACCACAGCCACAATACAAAAGCTACAGAGCAGCACAAGGATGCTTTACACAGCAGCAATTGTCAATACATAGTTGTGTTCAAAGTTTATAGAAAAGGCAACACACATATAGCTCATGAACTTCCCTTGTCTCCTACTACTAGTTTCCATAATCTGG...

XM_057908961.1
TCAGACAGCATTATGAGCTAAATGATTGGCTGACAAACATCTTCACTCTCTTACAAGCAAAGGATATATTCTTGTACGACTAATTTTATTCGAACCGACCATAGACCACAGCCACAATACAAAAGCTACAGAGCAGCACAAGGATGCTTTACACAGCAGCAATTGTCAATACATAGTTGTGTTCAAAGTTTATAGAAAAGGCAACACACATATAGCTCATGAACTTCCCTTGTCTCCTACTACTAGTTTCCATAATCTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985821
ATGAACTTCCCTTGTCTCCTACTACTAGTTTCCATAATCTGGTGTGCTGAGACGTCTTCTTCCAATGAGTCCCTTCACCAGGAAACTGATGACAACCACCAACAGCAGGTCGCATCTCTGGAGAATCGAAGCAACGGGATCACTGCAGGCTGGCAGTACCACTACTACAAGCATCATGCCTTGAGAACAGTTCACGGAACTGTAAACATCGTGGGGTGGGGAGTCCTGTTGCCGACGGGTGTGATCGTGGCGCGCTACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764944.1
MNFPCLLLLVSIIWCAETSSSNESLHQETDDNHQQQVASLENRSNGITAGWQYHYYKHHALRTVHGTVNIVGWGVLLPTGVIVARYLRESRSNDWYNLHIITQFSGFLLGTLGWGIGISIKNQAKQQRMSTHGILGTLIFALATLQLLGICLLPDEEHRCRRYWVIYHNVVGYALILLIIVNIFQGIGNQKAPKTWDLFYGAVLGVLGMIALALQILRWIYA

XP_057764946.1
MNFPCLLLLVSIIWCAETSSSNESLHQETDDNHQQQVASLENRSNGITAGWQYHYYKHHALRTVHGTVNIVGWGVLLPTGVIVARYLRESRSNDWYNLHIITQFSGFLLGTLGWGIGISIKNQAKQQRMSTHGILGTLIFALATLQAYVCCLMKSTGAGDIGSSITTLWDMPSFFSSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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