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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001126`

染色体: Chr05 坐标: 9405118-9406485 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001126`
名称	SmilChr05G001126
描述	amino acid transporter AVT6E-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9405118 - 9406485 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985830`
GeneID	`130985830`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985830`
原始查询	`LOC130985830`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid transporter AVT6E-like
产物	amino acid transporter AVT6E-like
Arabidopsis	`AT1G80510` (AT1G80510) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844390] identity=76.1; qcov=0.681; evalue=2.99e-108; confidence=high
Rice	`Os06g0644700` (OsATL1) - identity=65.5; qcov=0.681; evalue=3.08e-90; confidence=high
GO	GO:0003333 (amino acid transmembrane transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985830

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057764963.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057764963.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057764963.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764963.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057764963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9405439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C59,C82,D2
`Chr5:9405448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C31
`Chr5:9405460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D2
`Chr5:9405460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr5:9405463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:9405465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B25,B88
`Chr5:9405466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B26,C71,C77
`Chr5:9405468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C10
`Chr5:9405479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C44,C59,D2
`Chr5:9405495`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B11,B12,B129,B133,B137,B32,B36,C14,C26,C42,C63,C83
`Chr5:9405593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr5:9405603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764963.1

332 aa

166

332

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 105-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764963.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	105	321	1.2e-30	107.3	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908980.1
ATAGTTTATGACTTTGATAGCCACCATTTTTAAAGAATGACTTTTGGGGTCAAAATGCATTGAAAAGACAAACATGCCCTTACTAATTACTGAATAAAAATAAAGCAAAATTGAAAAGAAAATTATTTGACTTAAAGAATAAAAAATAAAAGAAAAATTAGAAAGGTTAATTAAAAGAAAAATAGAACAGATTTGAATCAAAATTTTTCTCTAAAATCGGTTTCTCTCTCTCTCCAGAAAACGCAAGCACTCACTCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985830
ATGAAAACCGCCACCTTCGAGTGGCTCTGCGGCCTCCTCGAGCTGCTCCTTGATTGCCGCGACCCCGTCGGCCCCCCGCTAGATCTGCCCGCCGAGACCCGCCTCGGAATCGGCCTGTTCCGCCTCACCACCGGCTCCGATCACTGCGAGATCTCCGCCCGCTTCGGAGTCTCCGAGGCCGTCTCCAAATTCTGCGTCAAGCAGATCTGCTGCGTGCTCTGCACCAACTACCGATTCTGGGTCGGATTTTCGGGCCACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764963.1
MKTATFEWLCGLLELLLDCRDPVGPPLDLPAETRLGIGLFRLTTGSDHCEISARFGVSEAVSKFCVKQICCVLCTNYRFWVGFSGHAELNRKEMQTSFLCLFVLGSKKDPYLKSGRTALGRTARTLSEICIIVNNAGVLVVYLIIIGDVMSGSLHHMGVFDQWWGHGFWDHRKIVILIVLVLFLAPLCTLDKIDSLSTTSAASVALAIVFVVVVFIVALIKLVEGKIEPPRMMPDFGSKKAILDLLVVIPIMSNAYVCHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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