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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001133`

染色体: Chr05 坐标: 9463088-9465615 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001133`
名称	SmilChr05G001133
描述	plant UBX domain-containing protein 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9463088 - 9465615 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985836`
GeneID	`130985836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985836`
原始查询	`LOC130985836`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant UBX domain-containing protein 4
产物	plant UBX domain-containing protein 4
Arabidopsis	`AT4G04210` (PUX4) plant UBX domain containing protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825736] identity=72.1; qcov=1.02; evalue=5.7e-148; confidence=high
Rice	`Os04g0464500` - identity=62.8; qcov=1.02; evalue=2.32e-120; confidence=high
GO	GO:0000045 (autophagosome assembly); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0007030 (Golgi organization); GO:0031468 (nuclear membrane reassembly); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061025 (membrane fusion)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00789 (UBX); PF08059 (SEP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764969.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764969.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764969.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764969.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9464216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:9464284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B7,C11,C69,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764969.1

303 aa

152

303

SEP

UBX

PF08059 SEP 118-191 aa PF00789 UBX 228-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764969.1`	Pfam	`PF08059`	SEP	Domain	118	191	3.4e-26	92.4	SEP domain
`XP_057764969.1`	Pfam	`PF00789`	UBX	Domain	228	302	2.6e-18	66.7	UBX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908986.1
GAAACCAGACTTTCTTACTCTCCTTATAAATAAATAAAAAATAAAAATATAAATAAATAAATAAAGGAGAGAAATTGTTCTGGCTCTTTCTTTTCTTTTCGTCTTCTTCCGTTGTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCAATTCCTACACCTTAAAACGAAAAATCAATCGAAATCAAGAGCATGGCTTCGCGCGACAAGAAACCCTCAAAACCCTCCACCAGTCGGACCGGTCGTATCCGGACTCTCTCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985836
ATGGCTTCGCGCGACAAGAAACCCTCAAAACCCTCCACCAGTCGGACCGGTCGTATCCGGACTCTCTCCGACCTGAATAGGCCGTCGGCTCACGACTCCGACAGTGACTCCGATGGCCCCCAGGAATACTATACCGGCGGGGAGAAAAGTGGTATGCTTGTCCAAGACCCATCCAAGGGTAATGACGTTGATGCAATTTTTGACCAAGCTCGGCAACTGGGGGCTACACAAGGGCCCTTGGAGAATCTTCAGCCATCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764969.1
MASRDKKPSKPSTSRTGRIRTLSDLNRPSAHDSDSDSDGPQEYYTGGEKSGMLVQDPSKGNDVDAIFDQARQLGATQGPLENLQPSSSSRSFTGTGRLLSGETVPTAPQQPESVVHNIVFWRNGFTVNDGPLRSLDDPENASFLESIRKSECPKELEPADRRSSVHVNLIRRDENCPEPEVRSVPFQGVGRTLGSSSVTVSAPETTIAAPLLSAPTPSEGLVVDKSLPSTTIQLRLADGTRMVAHFNHHHTIADIRSFID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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