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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001167`

染色体: Chr05 坐标: 9793050-9794668 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001167`
名称	SmilChr05G001167
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9793050 - 9794668 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985854`
GeneID	`130985854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985854`
原始查询	`LOC130985854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=22; qcov=0.723; evalue=1.43e-06; confidence=weak
Rice	`Os02g0328500` - identity=31.9; qcov=0.51; evalue=2.73e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765001.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765001.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765001.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765001.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9793128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C21,C83
`Chr5:9793170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:9793172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr5:9793234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:9793242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr5:9793275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C21
`Chr5:9793322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:9793328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C21,C83
`Chr5:9793338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:9793378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9793450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:9793457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B42,B43,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765001.1

314 aa

157

314

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 29-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765001.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	29	125	1e-05	27.1	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909018.1
GGCAGATTTTTGGTATGCTCCATCGATTTGGGGACATCGAGACGTGAATCGGCAAGACATTAGGTGAATCGTAAAGAGCGATTCAACGATTGATAATCGACAGTTACCAGAATATACTGGAGATGAGCTCTCCGCAGGAAGATATCGCTATAGACGGTAGCGAAATTGGTCGGGGGAGAGTTTCCAAATCAAAAAAGTCTCGCCGTAGCTGGTCAACACAAGAGGAGGCAGTCCTGTTGGTAGCACTGAAGGAGCTAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985854
ATGAGCTCTCCGCAGGAAGATATCGCTATAGACGGTAGCGAAATTGGTCGGGGGAGAGTTTCCAAATCAAAAAAGTCTCGCCGTAGCTGGTCAACACAAGAGGAGGCAGTCCTGTTGGTAGCACTGAAGGAGCTAGTTGTGCAGGGATGGAAAGCTGACAATGGGTTTCGAGCTGGGTACTTGAACAAACTCGAGGACGCGATGCGTAATGAGTTTCCGAATACGGACCTAAGGGGCATGCCACATATCAACTCAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765001.1
MSSPQEDIAIDGSEIGRGRVSKSKKSRRSWSTQEEAVLLVALKELVVQGWKADNGFRAGYLNKLEDAMRNEFPNTDLRGMPHINSKISAWKKNYNSLLLMFSKSGFGFNLKGTFMIDCTNELWEEIVKCDNNAENMRFKSWPLFEDWKQIFGKDRATGEHAEDVMEAVNKVYAADNMAQDSLGQSSHDEVANDTAEASACHNEKGAGTTRTSSKKRKARNAEVDILYLALKEISSNTDKRLADLANRTGYEFDLGKARQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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