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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001164`

染色体: Chr05 坐标: 9772146-9773462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001164`
名称	SmilChr05G001164
描述	uncharacterized SmilChr05G001164
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9772146 - 9773462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985860`
GeneID	`130985860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985860`
原始查询	`LOC130985860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0590366` - identity=30.2; qcov=0.607; evalue=1e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765008.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057765008.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765008.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765008.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9772421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C36,C72
`Chr5:9772431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B82,B95,C13
`Chr5:9772436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr5:9772573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C36,C72
`Chr5:9772579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B67,B75
`Chr5:9772594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C36,C72
`Chr5:9772610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B135,B25,B88,C25
`Chr5:9772618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	135	A13,A15,A16,A19,A2,A20,A22,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B126,B127,B129,B130,B132,B134,B135,B138,B14,B19,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B4,B43,B44,B45,B46,B48,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B8,B81,B82,B84,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B96,B97,B98,C10,C11,C13,C14,C16,C19,C2,C20,C27,C28,C29,C30,C31,C35,C36,C37,C4,C43,C45,C46,C47,C5,C50,C52,C53,C55,C57,C6,C60,C65,C67,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C86,D5,D7,D8
`Chr5:9772633`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B120,B67
`Chr5:9772633`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B120,B67
`Chr5:9772635`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B120,B67
`Chr5:9772635`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B120,B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765008.1

191 aa

191

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 27-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765008.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	27	123	2.2e-08	35.7	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909025.1
ATTTGAGGAAGAAGCAGCTACCATATTTTTCATTCTCGCGCCAAGAATAAGGGCTCTGGAATTTGGACAGTCGATTGGCATTTGCAGATTCAACTGAGGAGAAGAACACTAGCGCAAGAACATGAGTTCCGCGACACAAGATGGGAGCAACGGGTTTGTTCGTGGGGGTCGGGTAAACAAGACCGACAAGACTCGACGCAGTTGGTCTACTCAAGAGGAGGCAGTGCTGCTAGCGGCGTTGAAAGAATTGGTGGTGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985860
ATGAGTTCCGCGACACAAGATGGGAGCAACGGGTTTGTTCGTGGGGGTCGGGTAAACAAGACCGACAAGACTCGACGCAGTTGGTCTACTCAAGAGGAGGCAGTGCTGCTAGCGGCGTTGAAAGAATTGGTGGTGCAAGGATGGAAATCCGACAACGGATTTCGGCCAGGTTATTTGACTAAGTTGGAGGAGGCTATGAAAAAGGTATTCCCAACCACTGACTTGAAAGGGATGCCACATATAAACTCAAAAACCACGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765008.1
MSSATQDGSNGFVRGGRVNKTDKTRRSWSTQEEAVLLAALKELVVQGWKSDNGFRPGYLTKLEEAMKKVFPTTDLKGMPHINSKTTTWKKQYYSLTQILGNTGVGFNVNGMHMVDCNDEQWEQIIKVSRCSYCNIKFRLYKSVPIGLRDIAKILETHVTISEKLNAFLDVSESKISIKLCVECLHGEDESG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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