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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001184`

染色体: Chr05 坐标: 9934897-9938261 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001184`
名称	SmilChr05G001184
描述	F-box protein CPR1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9934897 - 9938261 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985882`
GeneID	`130985882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985882`
原始查询	`LOC130985882`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein CPR1-like
产物	F-box protein CPR1-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=33.6; qcov=1.07; evalue=3.61e-67; confidence=low
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=24.2; qcov=0.94; evalue=8.17e-17; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765030.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765030.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765030.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765030.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9937494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:9937509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C23,C82
`Chr5:9937650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B2,C61
`Chr5:9937979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C51
`Chr5:9937980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B3,B37,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765030.1

386 aa

193

386

F-box-like

F-box

FBA_3

FBA_1

PF12937 F-box-like 2-37 aa PF00646 F-box 2-41 aa PF08268 FBA_3 88-336 aa PF07734 FBA_1 89-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765030.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	2	37	2.5e-06	27.9	F-box-like
`XP_057765030.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	2	41	4.6e-08	33.4	F-box domain
`XP_057765030.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	88	336	4.5e-18	66.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057765030.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	89	312	2e-21	77.0	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089108.1
TTGAGAAAGTATAAATAGTGTGGGGGAAGAATTTTAAATTGAAAATGATGTGAAGGTTGAAAGTAAAAAGGCAACGAAATTGGTACAAATTCTTATCCTCTCGCACACGCAACAGCATCTTTTAGACGCGGCACTTTGTCGATCAATCAAATCTTACCCCCGAAGAACTTCCCAACCCTAATTTCATTTCACTCGCACAAAATGTCTACTCTACCGTTCGAGATAATCGAGGACATCCTCCGCCGCCTACCTGTGAGATC...

XR_009089109.1
AAGAATTTTAAATTGAAAATGATGTGAAGGTTGAAAGTAAAAAGGCAACGAAATTGGTACAAATTCTTATCCTCTCGCACACGCAACAGCATCTTTTAGACGCGGCACTTTGTCGATCAATCAAATCTTACCCCCGAAGAACTTCCCAACCCTAATTTCATTTCACTCGCACAAAATGTCTACTCTACCGTTCGAGATAATCGAGGACATCCTCCGCCGCCTACCTGTGAGATCCCTGAAGCGGCTCCGCGCCGTCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985882
ATGTCTACTCTACCGTTCGAGATAATCGAGGACATCCTCCGCCGCCTACCTGTGAGATCCCTGAAGCGGCTCCGCGCCGTCGCCAAATCGTGGTGCTTTCTCATCGACAGCTCAAATTTCGTCAAATTGCACCTGCGTCAGTCCCTAATTTCAAATTCCCACCGGAATCTCATAATCGGCGGCCTCGGCGTTTACTCGGTCGATTTGGACTCTCCGGAGAAGGCGCAGGTTATCAAGCCGCCGTTCTATTACAAGAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765030.1
MSTLPFEIIEDILRRLPVRSLKRLRAVAKSWCFLIDSSNFVKLHLRQSLISNSHRNLIIGGLGVYSVDLDSPEKAQVIKPPFYYKSVDAISNSCNGIVLVMSEPPVMWNPFSMDYKALPECGADYPAEPLSYSRTTFGFGYDSTNDDYKVVRIVEFRNERSHVWMHSEAMIYGLKSNRWRRLEHFSYPLPFLRGHWRVHVNGALHTLVAESDNQFTVKIMAFSVENEGHYVVAMPQGVQIKGVDMSLDVIDGCLSLVCAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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