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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001188`

染色体: Chr05 坐标: 9970081-9970750 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001188`
名称	SmilChr05G001188
描述	cysteine proteinase inhibitor 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9970081 - 9970750 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985885`
GeneID	`130985885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985885`
原始查询	`LOC130985885`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine proteinase inhibitor 5-like
产物	cysteine proteinase inhibitor 5-like
Arabidopsis	`AT5G47550` (AT5G47550) Cystatin/monellin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834805] identity=54.2; qcov=0.814; evalue=6.11e-28; confidence=medium
Rice	`Os03g0429000` - identity=45; qcov=0.771; evalue=6.05e-20; confidence=low
GO	GO:0004869 (cysteine-type endopeptidase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00031 (Cystatin); PF16845 (SQAPI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057765034.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057765034.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057765034.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765034.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9970319`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A9,B10,B126,B37,B45,B57,B65,B73,B86,B88,C1,C11,C12,C21,C23,C29,C35,C4,C43,C69,C83,C9,D1,D6,D9
`Chr5:9970324`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A9,B10,B32,B37,B45,B57,B65,B73,B86,B88,C1,C11,C12,C21,C23,C29,C35,C4,C43,C69,C83,C9,D1,D9
`Chr5:9970335`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A13,B98,C30,C57,C70,D5
`Chr5:9970337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A9,B10,B126,B32,B37,B45,B57,B60,B65,B73,B86,B88,C1,C11,C12,C21,C23,C26,C29,C35,C4,C43,C69,C83,C9,D1,D9
`Chr5:9970346`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A13,B98,C30,C57,C70,D5
`Chr5:9970358`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A13,B98,C30,C57,C70,D5
`Chr5:9970380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr5:9970446`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C30
`Chr5:9970446`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C30
`Chr5:9970455`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C30
`Chr5:9970455`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C30
`Chr5:9970462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765034.1

118 aa

118

Cystatin

SQAPI

PF00031 Cystatin 28-113 aa PF16845 SQAPI 33-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765034.1`	Pfam	`PF00031`	Cystatin	Domain	28	113	4e-15	56.5	Cystatin domain
`XP_057765034.1`	Pfam	`PF16845`	SQAPI	Domain	33	115	1.1e-30	106.5	Aspartic acid proteinase inhibitor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909051.1
TGTATTTAATTACAACTTCATGACTAAGGTTCCTTTTATGTGTAAAGTATCTTTCATCTACATCTGTAATTTGTGAAAGGAAAAGCGTGTTAATTACTCGGGAATGGCTATAAATACAACTGTCCCACACACGGTTTCACCCACCCAATATTCAGAGTCGAGAAAATCATGGCACTCAAATCTATTCACATTCTCCTCGCCTTCCTCTCACTTCTGGCGGTTTCAGCCGCTTCCCGCGGCCCCATAGTCGGCGGCTGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985885
ATGGCACTCAAATCTATTCACATTCTCCTCGCCTTCCTCTCACTTCTGGCGGTTTCAGCCGCTTCCCGCGGCCCCATAGTCGGCGGCTGGCACCCGATCTCCAATCCCAATGCACCGGAGATTGTTGAAATCGCGAAATTCGCGGTGGCCGAACACAACAAAGAGAAGAAAGCGTCCTTGATTTTCGTGTCTGTGGTCAAGGGAGAATCGCAGGTGGTGGCTGGTACCAATTACAGGCTCGTGATCTCCGCCAAGGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765034.1
MALKSIHILLAFLSLLAVSAASRGPIVGGWHPISNPNAPEIVEIAKFAVAEHNKEKKASLIFVSVVKGESQVVAGTNYRLVISAKDGASAAPKTYTAVVWSKVAPKSLELTSFEQIKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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