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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001193`

染色体: Chr05 坐标: 9993009-9994770 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001193`
名称	SmilChr05G001193
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9993009 - 9994770 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985889`
GeneID	`130985889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985889`
原始查询	`LOC130985889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530
产物	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530
Arabidopsis	`AT5G47530` (AT5G47530) Auxin-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834803] identity=56.7; qcov=0.967; evalue=1.31e-161; confidence=high
Rice	`Os03g0194900` - identity=52.8; qcov=0.924; evalue=8.83e-123; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561); PF04526 (DUF568)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765036.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765036.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765036.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765036.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765036.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9993462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr5:9993930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr5:9994103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:9994240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:9994430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:9994444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765036.1

394 aa

197

394

DUF568

Cytochrom_B561

PF04526 DUF568 85-183 aa PF03188 Cytochrom_B561 228-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765036.1`	Pfam	`PF04526`	DUF568	Family	85	183	5.5e-28	98.4	Protein of unknown function (DUF568)
`XP_057765036.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	228	329	1.6e-06	29.1	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909053.1
TCCAAATCAATTAACAATCACATTTTTTCTTAGGGTATGGTTGGACGACACATCACTTTATTCTAGTACAATTGTGGTTGGAGTTAGACCTAAAACAAGGGTAGTTGTAACCTAAAACAAATTAGGAATCCAAATATTGGCAGGTGCAATAATCTCGAAAATATTTACCAAATTGTAACTACTCATGTCCCCACTATTTCTCTTTTCTTTTATAAAAGCCAAAGCCCCCGTCTCCAAACCATCCCATTCTTGATCAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985889
ATGTCGAGGCCCGCCTTGATCGCGTGTCTCCTCTTGTGTGTCTACACATGCTCGTCCCACGCCCAATCATGCGCCTCCTACAACTTCGCCGCGAAGCAGACATTCAGCCACTGCGCCGATCTCCCTTATCTCAACTCCTTCCTCCACTGGAACTACGACCAATCTACCAAAACAGTCCAAATCGGGTACCGCCACGCCGGGGTGGCGGCATCCAGATGGGTGGCCTGGGCGATCAATCCCACCGCCGGAGGGATGATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765036.1
MSRPALIACLLLCVYTCSSHAQSCASYNFAAKQTFSHCADLPYLNSFLHWNYDQSTKTVQIGYRHAGVAASRWVAWAINPTAGGMIGAQALVAFQKSDGTIRAYTSPVSGYQTRLQEGNLSFPVSDLSATYAGNEYTIFATLKLDNVSSAVNQVWQEGPLSGDSPATHPISGANVQSAGNLNLLSGQTGTTSGALDSRTKKKNIHGVLNAVSWGILLPIGAITARYLKVFPAADPTWFYLHALCQSSAYIIGVAGWATGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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