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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001212`

染色体: Chr05 坐标: 10189051-10202173 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001212`
名称	SmilChr05G001212
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10189051 - 10202173 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985909`
GeneID	`130985909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985909`
原始查询	`LOC130985909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=27.9; qcov=0.803; evalue=1.66e-20; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765068.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765068.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765068.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765068.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765068.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10201223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B38,B39
`Chr5:10201255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:10201313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B88
`Chr5:10201319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,D8
`Chr5:10201321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr5:10201351`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B111,B131,B140,B37,C2
`Chr5:10201351`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B111,B131,B140,B37,C2
`Chr5:10201390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:10201467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr5:10201599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B138,B18,B97
`Chr5:10201617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,D8
`Chr5:10201620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765068.1

290 aa

145

290

FBA_3

PF08268 FBA_3 18-230 aa

XP_057765069.1

290 aa

145

290

FBA_3

PF08268 FBA_3 18-230 aa

XP_057765070.1

290 aa

145

290

FBA_3

PF08268 FBA_3 18-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765068.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	18	230	9e-18	65.1	F-box associated beta propeller domain
`XP_057765069.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	18	230	9e-18	65.1	F-box associated beta propeller domain
`XP_057765070.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	18	230	9e-18	65.1	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909086.1
TTGTTTTTTAGGAACGAAAAGAACATACAATCGATTCTCAAGCTTTTAAGGGAGGGACACTATAAAATCGGTTTTGGAAAAAGGGAAAGACAATCCCTTCCTCTCACCCACTCCGCCAGCTACCCACATCAGAACTCCTCTCCTTTAAATTTTCAAAATTCGCAACTTCAACTCTCCAACGCCGACGATTGTCGACTGCTTCCGCGGGCTCGCCACCGCCAAGAAGCTGCTGCCTTCACTCGGACCTTTAGTCATTCTGT...

XM_057909085.1
TTGTTTTTTAGGAACGAAAAGAACATACAATCGATTCTCAAGCTTTTAAGGGAGGGACACTATAAAATCGGTTTTGGAAAAAGGGAAAGACAATCCCTTCCTCTCACCCACTCCGCCAGCTACCCACATCAGAACTCCTCTCCTTTAAATTTTCAAAATTCGCAACTTCAACTCTCCAACGCCGACGATTGTCGACTGCTTCCGCGGGCTCGCCACCGCCAAGAAGCTGCTGCCTTCACTCGGACCTTTAGATGCTACCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985909
ATGTTCCGTCACCAAACTGCTATTGATGCAACGGATTTCGTCCGCCAATTTCAGGGGACACCATGTCTCTATGCCTTGTGCCATGAACTGTTGTGTGTTGAAGTTGACAACTCGTTGTTTCTGTGGAATCCTTCGATGAGGATTTACAGGAAGCTCCCCAATCCATTGTTTCAAGCACGGGATGGAATTGGGATTGATTGGTACGACGGGTATGATTTTGAAGTTGGGATTGGACAGTACAACAGGTATGAGTTTGTTTA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765068.1
MFRHQTAIDATDFVRQFQGTPCLYALCHELLCVEVDNSLFLWNPSMRIYRKLPNPLFQARDGIGIDWYDGYDFEVGIGQYNRYEFVYGLGYDSAADDYKILKIPRMNSRCRETELYSLKRNCWRKIDSFSAKPSFSQERCEFVDGTFHWLTISATYSQAIIVSFCLSTEEYGEVVQPEYFPVPNLFGDDVLEVVAVRGMLCVCVNYCRETRFVLWVMEEYGVERCWTKKFDIQYRSSRPYFPFPTSAESLFTLKPLYFYD...

XP_057765069.1
MFRHQTAIDATDFVRQFQGTPCLYALCHELLCVEVDNSLFLWNPSMRIYRKLPNPLFQARDGIGIDWYDGYDFEVGIGQYNRYEFVYGLGYDSAADDYKILKIPRMNSRCRETELYSLKRNCWRKIDSFSAKPSFSQERCEFVDGTFHWLTISATYSQAIIVSFCLSTEEYGEVVQPEYFPVPNLFGDDVLEVVAVRGMLCVCVNYCRETRFVLWVMEEYGVERCWTKKFDIQYRSSRPYFPFPTSAESLFTLKPLYFYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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