当前解析结果
SmilChr05G001218| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001218 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001218 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001218 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 10221503 - 10222314 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985915 |
|---|---|
| GeneID | 130985915 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985915 |
| 原始查询 | LOC130985915 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827335]; symbol=AT4G16410; hit=AT4G16410; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827335]; symbol=AT4G16410; hit=AT4G16410; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G16410 (AT4G16410)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827335] identity=63.4; qcov=0.636; evalue=3.7e-43; confidence=medium |
| Rice | Os07g0607200- identity=63.6; qcov=0.438; evalue=2.12e-30; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05421 (DUF751) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985915 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057765075.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057765075.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 1.00000 | XP_057765075.1 |
| 4 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057765075.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765075.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:10221991 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr5:10222031 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C32,C68,D8 |
Chr5:10222172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B112,B63,B79,C54,D9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765075.1PF05421
DUF751 107-166 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765075.1 |
Pfam | PF05421 |
DUF751 | Family | 107 | 166 | 1.7e-21 | 77.4 | Protein of unknown function (DUF751) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。