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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001226`

染色体: Chr05 坐标: 10332894-10337456 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001226`
名称	SmilChr05G001226
描述	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10332894 - 10337456 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985924`
GeneID	`130985924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985924`
原始查询	`LOC130985924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-2
产物	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-2
Arabidopsis	`AT5G21170` (AKINBETA1) 5'-AMP-activated protein kinase beta-2 subunit protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832243] identity=47.6; qcov=1.02; evalue=9.52e-75; confidence=high
Rice	`Os05g0491200` (akin-b) - identity=47.2; qcov=0.816; evalue=1.13e-68; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF04739 (AMPKBI); PF16561 (AMPK1_CBM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765086.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765086.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057765086.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057765086.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057765086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10333182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,D3
`Chr5:10333219`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C21
`Chr5:10333219`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C21
`Chr5:10333253`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B109
`Chr5:10333253`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B109
`Chr5:10335564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C18,C29
`Chr5:10335847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B12,B131,B140,B37
`Chr5:10336931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:10336997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765086.1

283 aa

142

283

AMPK1_CBM

AMPKBI

PF16561 AMPK1_CBM 96-175 aa PF04739 AMPKBI 209-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765086.1`	Pfam	`PF16561`	AMPK1_CBM	Family	96	175	2.6e-32	111.6	Glycogen recognition site of AMP-activated protein kinase
`XP_057765086.1`	Pfam	`PF04739`	AMPKBI	Family	209	280	7.2e-24	84.3	5'-AMP-activated protein kinase beta subunit, interaction domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909103.1
AAAGGAAATGTAAAGATTTAAGAGGCAGGCCCCTGAAAGGAGGGTAGATATAGGGCCCTGTTATCCCCACCAGCAACACCACATTATTCGGCATCACCTCTTCCCCTCTCCCATATTAAACCCATTACCATTACCATTACCATTACCAACATACTTCCAAACTCACACCCCACATCAACATTCATTTCATCTTTTCCACTTACTTTCCCATTAATCTTCAATCCTAAACCACTCTACACTTTTACTCTCAACAATTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985924
ATGGGGAATGCCAACGGGAGGGAGGACGGCGGCAGCGACACCCAATCGGTGGTCGAGGACTCCGCCGCCGCGCAGGTTAGCATGGCCGATCAGGATGCTGCGCACGGCCCCGAGTACATGGGAGGCCACTCGCCCCCTTCTAGTCCTAGGGCTTCTCAGTCGCCTCTCATGTTCAGACCTCAGATGCCAGTGGTTCCTCTACAAAGACCTGATGAGTTGAACATCCCTAGCCCTTCATGGATGCAGACTAACTCAGGTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765086.1
MGNANGREDGGSDTQSVVEDSAAAQVSMADQDAAHGPEYMGGHSPPSSPRASQSPLMFRPQMPVVPLQRPDELNIPSPSWMQTNSGYEDVYNEQGIPTMITWSYGGKEVSVEGSWDSWKSRKPLQRSGKDFTIMKVLPSGVYQYRFLVDGQWRHSPDLPWEQDDSGNAYNVLDLQDYVPEDIDSISGFEPPQSPDSSYNNTQLGQEDFGKEPPMVPPHLNLTLLNAPSPQMEIPPPYSRPQHVVLNHLYMHRDRSRPSVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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