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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001233`

染色体: Chr05 坐标: 10443417-10461552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001233`
名称	SmilChr05G001233
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10443417 - 10461552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985931`
GeneID	`130985931`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985931`
原始查询	`LOC130985931`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A
产物	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A
Arabidopsis	`AT5G47690` (AT5G47690) binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834820] identity=52.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0286351` - identity=49.2; qcov=0.859; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion)
KEGG	-
Pfam	PF20168 (PDS5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985931

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765094.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057765094.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765094.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765094.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10443785`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C48
`Chr5:10445304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr5:10445388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B25,C35,C67,C72
`Chr5:10445394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B25,C35,C67,C72
`Chr5:10445414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B82,C60
`Chr5:10445492`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B111,B124,B129,B136,B139,C16
`Chr5:10445493`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A13,A21,A5,B103,B108,B111,B118,B120,B125,B136,B17,B18,B47,B50,B66,B68,B84,C10,C11,C18,C28,C35,C38,C4,C58,C67,C72,C78
`Chr5:10445497`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A13,A21,A5,B103,B108,B111,B118,B120,B124,B125,B129,B136,B139,B17,B18,B47,B50,B66,B68,B84,C10,C11,C16,C17,C18,C28,C35,C38,C4,C58,C67,C72,C78,C87
`Chr5:10445638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B20,B33,B62
`Chr5:10445780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:10446681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:10446714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B12,B131,B140,B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765094.1

1689 aa

844

1689

PDS5

PF20168 PDS5 24-1086 aa

XP_057765095.1

1684 aa

842

1684

PDS5

PF20168 PDS5 24-1086 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765094.1`	Pfam	`PF20168`	PDS5	Repeat	24	1086	6e-253	842.9	Sister chromatid cohesion protein PDS5 protein
`XP_057765095.1`	Pfam	`PF20168`	PDS5	Repeat	24	1086	5.9e-253	842.9	Sister chromatid cohesion protein PDS5 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909111.1
GGTGAAGCCCCGCTCCGCTCCGGTTCTTACTTCTTACCAATAAACCTGTTTATTTATATTTCCAGCAAAAGCACATATTTTCTCGTTCCATTGTTCGAAACAACGACGAAAAGCCAAATAGAAATTCAAAAAAACCCCCAAATTCACTATACTCGCACTCACACACACGCAGCGGAAACACACATTCCAAACACGCTGAGCCCGACCGCCTTTTTTTCATGTGAGAATTCGACTTCAATTTTGAAGTTGGCTGAAATTCC...

XM_057909112.1
GGTGAAGCCCCGCTCCGCTCCGGTTCTTACTTCTTACCAATAAACCTGTTTATTTATATTTCCAGCAAAAGCACATATTTTCTCGTTCCATTGTTCGAAACAACGACGAAAAGCCAAATAGAAATTCAAAAAAACCCCCAAATTCACTATACTCGCACTCACACACACGCAGCGGAAACACACATTCCAAACACGCTGAGCCCGACCGCCTTTTTTTCATGTGAGAATTCGACTTCAATTTTGAAGTTGGCTGAAATTCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985931
ATGGCGCAGAAGCTGCAGCAGCAGCTTAAAGAACTTGGATCGAAGTTGGAGGCTCTTCCGTCTTCGAAAGATGCTCTCATTAAACTCTTGAAGCACGGCGTGACATGCCTAACTGAATTAGATCAATCACCACCCAAAACAATGTTGGAGTCCATGCAGTCTTTCTTGAATGCTATTGTGAAGCCAGAGCTATTGAAACATCACGATCGAGAAGTAAAGCTTTTCGTTGCTGCATGTATATGTGAAATAACTCGAATTAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765094.1
MAQKLQQQLKELGSKLEALPSSKDALIKLLKHGVTCLTELDQSPPKTMLESMQSFLNAIVKPELLKHHDREVKLFVAACICEITRITAPEAPYEDDIMKDIFQLTVSTFSGLSDINSPSFGRILVILETLARYRSCVVMLDLECDDLIKDMFSTFFTVARDEHPENVFTSMQTIMEVLLEESEDVPDNLLLTLLSVLGRDNEDVTMAARRLAMNVVECCAGKLEPGIKQFLVSSMSGDSRSPKPEINYHAVLYNIYRSAP...

XP_057765095.1
MAQKLQQQLKELGSKLEALPSSKDALIKLLKHGVTCLTELDQSPPKTMLESMQSFLNAIVKPELLKHHDREVKLFVAACICEITRITAPEAPYEDDIMKDIFQLTVSTFSGLSDINSPSFGRILVILETLARYRSCVVMLDLECDDLIKDMFSTFFTVARDEHPENVFTSMQTIMEVLLEESEDVPDNLLLTLLSVLGRDNEDVTMAARRLAMNVVECCAGKLEPGIKQFLVSSMSGDSRSPKPEINYHAVLYNIYRSAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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