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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001247`

染色体: Chr05 坐标: 10598015-10601637 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001247`
名称	SmilChr05G001247
描述	farnesyl pyrophosphate synthase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10598015 - 10601637 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985942`
GeneID	`130985942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985942`
原始查询	`LOC130985942`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	farnesyl pyrophosphate synthase
产物	farnesyl pyrophosphate synthase
Arabidopsis	`AT5G47770` (FPS1) farnesyl diphosphate synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834828] identity=79.2; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0543400` (OsFPPS2) - identity=71.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004161 (dimethylallyltranstransferase activity); GO:0004337 ((2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0045337 (trans, trans-farnesyl diphosphate biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00348 (polyprenyl_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765118.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765118.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765118.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765118.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765118.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10598419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B17,B24
`Chr5:10598508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B60
`Chr5:10598508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr5:10600843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765118.1

349 aa

174

349

polyprenyl_synt

PF00348 polyprenyl_synt 40-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765118.1`	Pfam	`PF00348`	polyprenyl_synt	Domain	40	304	3.1e-80	269.7	Polyprenyl synthetase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909135.1
ATCAAACAAAGCGGCGAATCTCCGTATATAGTGGTCATGCCACCAACCCAGTCCCCACTGACACGTGTTTTCTTACTATTGGCGTCGATGATAACGAGGATTTTTCATTCCCCAAAATACCCTCCGTCAAGTCCGTCAGCTCTCCCATCCCCGGAAGACAACAGCAGACCCATTTTCGGGAATCAAGCAACTAAATTTTGACGTCGCCAATAGCAGCCCTTGCCCTCCAAAATAAACAAATGGAATGTGAACACCACCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985942
ATGGCGAATCTGAACGGAGAGTCGGCGGATCTGAGGGCGACGTTTCTGGGGGTTTATTCGGTGCTTAAATCTGAGCTCTTGAACGACCCTGCTTTCGAGTGGACTGATGGTTCTCGTCAATGGGTCGAGCGTATGCTGGACTATAATGTACCTGGAGGGAAATTAAACCGAGGCCTGTCAGTCATTGATAGCTACAAGTTACTAAAAGGAGGAAAAGATCTAACTGATGATGAAGTGTTTCTAGCTAGTGCTCTTGGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765118.1
MANLNGESADLRATFLGVYSVLKSELLNDPAFEWTDGSRQWVERMLDYNVPGGKLNRGLSVIDSYKLLKGGKDLTDDEVFLASALGWCVEWLQAYFLVLDDIMDNSHTRRGQPCWFRVPKVGMIAINDGIILRNHIPRILKKHFRTKPYYVDLLDLFNEVEFQTASGQMIDLITTIEGEKDLSKYSLPLHRRIVQYKTAYYSFYLPVACALLMAGEDLEKHPTVKDVLINMGIYFQVQDDYLDCFGEPEKIGKIGTDIED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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