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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001248`

染色体: Chr05 坐标: 10620046-10625383 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001248`
名称	SmilChr05G001248
描述	C2 and GRAM domain-containing protein At1g03370
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10620046 - 10625383 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985943`
GeneID	`130985943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985943`
原始查询	`LOC130985943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	C2 and GRAM domain-containing protein At1g03370
产物	C2 and GRAM domain-containing protein At1g03370
Arabidopsis	`AT1G03370` (AT1G03370) C2 calcium/lipid-binding and GRAM domain containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839519] identity=64.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0297800` - identity=56.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF02893 (GRAM); PF16016 (VASt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057765119.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057765119.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057765119.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765119.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10621347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B56,B96
`Chr5:10621860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B88,C17,C5,C58
`Chr5:10622158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:10622179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B63,B79,C54
`Chr5:10622295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:10622418`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr5:10622418`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr5:10622440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:10622951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B12,B131,B140
`Chr5:10623235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:10623893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B87
`Chr5:10623916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765119.1

1057 aa

528

1057

VASt

GRAM

VASt

PF00168 C2 2-104 aa PF16016 VASt 261-409 aa PF00168 C2 544-645 aa PF02893 GRAM 697-804 aa PF16016 VASt 894-1036 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765119.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	2	104	1.2e-45	154.7	C2 domain
`XP_057765119.1`	Pfam	`PF16016`	VASt	Domain	261	409	1.2e-58	198.5	VAD1 Analog of StAR-related lipid transfer domain
`XP_057765119.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	544	645	1.2e-45	154.7	C2 domain
`XP_057765119.1`	Pfam	`PF02893`	GRAM	Domain	697	804	1.3e-19	70.8	GRAM domain
`XP_057765119.1`	Pfam	`PF16016`	VASt	Domain	894	1036	1.2e-58	198.5	VAD1 Analog of StAR-related lipid transfer domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909136.1
AATAAAGTGAAAACGCATAGAAAAGTCTGCGTGCCTTTCATTTTTTCCAACTAAATTTCCCTCTCTCTCTCTCTTACTTATGAGTTATGAGAGAGAAGCGGTCGAGTCCACGAACCAACAAATTTGATCTCGGAATTTTCCTGGGGTTTTAACATCTATCCAATTACTTCTCCCTTGTTGAGATTTATCCGCTTTCTCGCTCCATCAATCATTAGCTTCTGTCGGCTTTCTTTCTGCTTTTCTTGTCTTGATTCTTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985943
ATGAAGTTATTAGTGCGAGTGATCGAAGCAAAAAACATACCGGCGCTCGACCCAAATGGATTCAGCGATCCGTATGTGAAACTGCAATTGGGGAGGCAGAGGTTTAAGAGTAAAGTTGTGAAGAAGAGCTTGAATCCATCGTGGTGTGAGGAGTTCATATTCAAAGTTGATGACTTGAAAGAAGAGCTTCTTATATCTGTTTTGGATGAAGACAAGTACTTCAATGACGATTTCGTTGGGCAGATCAAAGTGCCCATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765119.1
MKLLVRVIEAKNIPALDPNGFSDPYVKLQLGRQRFKSKVVKKSLNPSWCEEFIFKVDDLKEELLISVLDEDKYFNDDFVGQIKVPIIQVLDAKDKSLGTAWYTLQPKTKKAKNKDCGEILLTICFSQNNTLLDVPPMSDPVTLPRKSADMTSDPPSRSSPLRAPPSPMRSEDVVPPKEEKWNASTLAGRIAQIFNKNVDSASVSSVEPSDASEVSEAVDSVVPQHNPEEQNSSVDFDDMMKSIEMRDQGGEVPSSLPGGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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