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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001249`

染色体: Chr05 坐标: 10625971-10630718 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001249`
名称	SmilChr05G001249
描述	protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R8 homolog
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10625971 - 10630718 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985944`
GeneID	`130985944`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985944`
原始查询	`LOC130985944`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R8 homolog
产物	protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R8 homolog
Arabidopsis	`AT5G47790` (AT5G47790) SMAD/FHA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834830] identity=54.4; qcov=1; evalue=1.75e-154; confidence=high
Rice	`Os08g0326100` (OJ1136_A10.104) - identity=58.4; qcov=1; evalue=1.66e-166; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00498 (FHA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985944

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765120.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057765120.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057765120.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057765120.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057765120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10626828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C70
`Chr5:10626950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:10628230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:10628252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B4,B54,C18,C29
`Chr5:10628328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr5:10628333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B12,B131,B140
`Chr5:10628652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765120.1

431 aa

216

431

FHA

PF00498 FHA 129-195 aa

XP_057765121.1

431 aa

216

431

FHA

PF00498 FHA 129-195 aa

XP_057765123.1

431 aa

216

431

FHA

PF00498 FHA 129-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765120.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	129	195	6.3e-18	65.7	FHA domain
`XP_057765121.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	129	195	6.3e-18	65.7	FHA domain
`XP_057765123.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	129	195	6.3e-18	65.7	FHA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089120.1
CCCTCAATTCATTCAATCACTCATTCTCCTTGAGCTACTTGTCGATCTGCATCTCCCTCTTTTCCACGCTCGATATTCGATCTCCAGTAGTCCCACTCCCCAATTTCTAGGGCTCATTAACATCCATACATACAAGGACAAGCAAATTTCTCTCAGTGGGTTGACATTGAAAAGGGAAGCAAAATCTATTCGTATGTTGAAATCTTGTTTTAGTGTTGGAATGATGGTGCTGGCATGTTGCATCCTTAGTGCCTGACTTA...

XR_009089124.1
CCCTCAATTCATTCAATCACTCATTCTCCTTGAGCTACTTGTCGATCTGCATCTCCCTCTTTTCCACGCTCGATATTCGATCTCCAGTAGTCCCACTCCCCAATTTCTAGGGCTCATTAACATCCATACATACAAGGACAAGCAAATTTCTCTCAGTGGGTTGACATTGAAAAGGGAAGCAAAATCTATTCGTATGTTGAAATCTTGTTTTAGTGTTGGAATGATGGTGCTGGCATGTTGCATCCTTAGTGCCTGACTTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985944
ATGTATGGAAGAGCGGGTCTTGATCGTTTCAGGAAAGCACAGTCTTCGGAACCTTTTGCAGTCACTGCTACTTCTGCCACTAAAACAGCCATACCACCTGGTTTAGGAGAAGCTGTCCATCCTACAGTAGTTTCCGGTAATCAAGCTCAAGGATCATATCTGCAGAACCAACATCTAAGTTCTCAGAATGTGGTAAAAAGACCTTTCACAACGGATGCACCCCCAACTTCGGTTCCAACTCAGCATGCGACACCGGTTGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765120.1
MYGRAGLDRFRKAQSSEPFAVTATSATKTAIPPGLGEAVHPTVVSGNQAQGSYLQNQHLSSQNVVKRPFTTDAPPTSVPTQHATPVGGGHSTWQPPDWAIEPRPGVYYLEVLKDGEVLDRINLDKRRHIFGRQFHACDFVLDHQSVSRQHAAVIPHKDGSIYVIDLGSAHGTFVANERLAKDSPVELEAGQSLRFAASTRTYVLRKNNDALFPPPPQPSEIDLPPPPDPSDEEAVLAYNTFINRSLNGLVTPNTLSNSTN...

XP_057765121.1
MYGRAGLDRFRKAQSSEPFAVTATSATKTAIPPGLGEAVHPTVVSGNQAQGSYLQNQHLSSQNVVKRPFTTDAPPTSVPTQHATPVGGGHSTWQPPDWAIEPRPGVYYLEVLKDGEVLDRINLDKRRHIFGRQFHACDFVLDHQSVSRQHAAVIPHKDGSIYVIDLGSAHGTFVANERLAKDSPVELEAGQSLRFAASTRTYVLRKNNDALFPPPPQPSEIDLPPPPDPSDEEAVLAYNTFINRSLNGLVTPNTLSNSTN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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