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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001251`

染色体: Chr05 坐标: 10642055-10645817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001251`
名称	SmilChr05G001251
描述	BTB/POZ domain-containing protein At5g47800
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10642055 - 10645817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985946`
GeneID	`130985946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985946`
原始查询	`LOC130985946`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At5g47800
产物	BTB/POZ domain-containing protein At5g47800
Arabidopsis	`AT5G47800` (AT5G47800) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834831] identity=56.7; qcov=1.01; evalue=3.4e-174; confidence=high
Rice	`Os09g0420900` - identity=39.3; qcov=1.04; evalue=2.72e-101; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057765130.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057765127.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057765127.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765127.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765127.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10644099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:10644272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:10644315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:10644382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:10644715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr5:10644730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:10644805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B140
`Chr5:10644883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B101,B118,B70
`Chr5:10644889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B87
`Chr5:10644952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B138,B17,B24
`Chr5:10644991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr5:10645007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765127.1

519 aa

260

519

NPH3

PF03000 NPH3 198-439 aa

XP_057765128.1

519 aa

260

519

NPH3

PF03000 NPH3 198-439 aa

XP_057765130.1

420 aa

210

420

NPH3

PF03000 NPH3 198-414 aa

XP_057765131.1

420 aa

210

420

NPH3

PF03000 NPH3 198-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765127.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	198	439	3.2e-79	266.9	NPH3 family
`XP_057765128.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	198	439	3.2e-79	266.9	NPH3 family
`XP_057765130.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	198	414	2.9e-63	214.7	NPH3 family
`XP_057765131.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	198	414	2.9e-63	214.7	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909144.1
TATATCTTAATTAATTATATATATAATGTAGGTAGCTATAGGTAGCGTATAGCATAGCATCACCGAACTCTAACTTTATCTTTTTTCCAAGTTCAAGTAGATAATCATTAGCTTAGAAGCTTTCAAGTATGATGCCATTAATCAGCATGTTGACTATCACCACTTTCTGTGTCCAACCTCTCCTATTGTTTAATCACTCCATCTTTCTTTCTATTAAAACGAACAACCTTCTCTAGCCCTGTCATGACTGTGTGTGTTTT...

XM_057909147.1
TCTAACTTTATCTTTTTTCCAAGTTCAAGTAGATAATCATTAGCTTAGAAGCTTTCAAGTATGATGCCATTAATCAGCATGTTGACTATCACCACTTTCTGTGTCCAACCTCTCCTATTGTTTAATCACTCCATCTTTCTTTCTATTAAAACGAACAACCTTCTCTAGCCCTGTCATGACTGTGTGTGTTTTTACATATGCATGAATAGAATCTTTCTCTCAGAGCTAGGCTGCGTGTATGCTTTAATTTCTCTTTTAAT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130985946
ATGAAGTTCATGAAACTCGGAAGCCGTCCAGACACCTTCTACACAGAGGAGGCAACTAGGGCTGTGATGTCTGATGTACCAAGTGATCTGAGCATCAAGATAAACAACATCACTTATCTTGTCCACAAGTACCCAGTTGTTCCCAAGTGCGGGCTGCTGCAGCGGCTGTGCTCGGAGGCGGAGGCGGACAACGTGACTCTGGAGCTAGACGACTTCCCGGGAGGGGAGGAGGGCTTGGAGGTGTGCGCCAAGTACTGCTA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057765127.1
MKFMKLGSRPDTFYTEEATRAVMSDVPSDLSIKINNITYLVHKYPVVPKCGLLQRLCSEAEADNVTLELDDFPGGEEGLEVCAKYCYGITINLSAHNLASSFCAANYLAMTDAVEPGNLLMKLEAFFSSCILQSWKDPIVTLHNTHMVFDCSENLGIVRRCIESIVDKILTPPNKVTWSYTYTRPGYHKSRHQSVPKDWWTEDISFLNVDMFRCVVAAVKSANALHPQLIGEALHVYACRWMPEIAGEAEAEASTSRQED...

XP_057765128.1
MKFMKLGSRPDTFYTEEATRAVMSDVPSDLSIKINNITYLVHKYPVVPKCGLLQRLCSEAEADNVTLELDDFPGGEEGLEVCAKYCYGITINLSAHNLASSFCAANYLAMTDAVEPGNLLMKLEAFFSSCILQSWKDPIVTLHNTHMVFDCSENLGIVRRCIESIVDKILTPPNKVTWSYTYTRPGYHKSRHQSVPKDWWTEDISFLNVDMFRCVVAAVKSANALHPQLIGEALHVYACRWMPEIAGEAEAEASTSRQED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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