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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001268`

染色体: Chr05 坐标: 10806845-10810681 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001268`
名称	SmilChr05G001268
描述	protein PHR1-LIKE 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10806845 - 10810681 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985968`
GeneID	`130985968`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985968`
原始查询	`LOC130985968`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PHR1-LIKE 3-like
产物	protein PHR1-LIKE 3-like
Arabidopsis	`AT4G13640` (UNE16) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826998] identity=47.3; qcov=0.833; evalue=2.32e-64; confidence=high
Rice	`Os09g0299000` (OsPHL3) - identity=63.6; qcov=0.554; evalue=2.74e-72; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF14379 (Myb_CC_LHEQLE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985968

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765201.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765201.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765201.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765201.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765201.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10807167`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	B106,B128,B25,B58,B88,B92,B99,C18,C29,C37,C4,C42,C67,C85
`Chr5:10807169`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B96,B98,C18,C35
`Chr5:10807169`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B96,B98,C18,C35
`Chr5:10807172`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B106,B128,B88,B92,B99,C37,C4
`Chr5:10807184`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B25,B58,B96,B98,C18,C35,C42,C63,C67,C71,C85
`Chr5:10807193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C23,C35
`Chr5:10807236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B40,B49,C44,C5
`Chr5:10807241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B71,C45,C46
`Chr5:10807269`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr5:10807269`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr5:10807305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B126,B13,B139,B80,B87,C72
`Chr5:10807330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765201.1

312 aa

156

312

Myb_DNA-binding

Myb_CC_LHEQLE

PF00249 Myb_DNA-binding 45-96 aa PF14379 Myb_CC_LHEQLE 138-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765201.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	45	96	9.9e-08	32.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057765201.1`	Pfam	`PF14379`	Myb_CC_LHEQLE	Family	138	183	6.4e-17	61.7	MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909218.1
AAGAGACAAATACAGTGATCCGGCCAATCTGTCTACTGTAGTGTTTGTGTCTCATCTTCAATTATTCTCTCTCTCTCTCTCTTACCCGTGACACAGCCCTCCATTTTCACCGTGGGGTTAGGTAGGGTCCGAGTCGCCGAGGCAGTCCAATCTTCAGCCACTTCCATCATTTCTCTACTTTCTGCTATGCAAAAAATAAAGCTAAGCTATGGCAGCGGCAGCCAATAAACTATTCCAAGAACCAAAAGCCCTGTCTACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985968
ATGTTTCCCAGGTTGATTCAGCCACGCGACGCCATGCTACCCCAGGAAAACATCCAGCTCCCTAACGCCGCCTCCTACGGTCAACGGGGTGGCGGCGACCCCTGCTTGGTCCTCACATCCGACCCCAAGCCCCGCCTTCGCTGGACCGCTGACCTCCACGAGCGCTTCGTCGACGCCGTCGCTCAGCTCGGTGGCGCCAGCAAGGCCACTCCTAAGGCTATAATGCGTACAATGGGTGTCAAGGGGTTGACTTTGTTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765201.1
MFPRLIQPRDAMLPQENIQLPNAASYGQRGGGDPCLVLTSDPKPRLRWTADLHERFVDAVAQLGGASKATPKAIMRTMGVKGLTLFHLKSHLQKYRLGKQSGKELGEASKDGAYLLDSPRASNSPQNLQASDINEGYEVKEALRAQMEVQSKLHLQVEAEKHLQIRQEAERRYLAMLERACKMLADQILGTTVTNDDGDGYEGKGTKASPNNSQTPLGSIPSQSADELGAPGIVELTPNLHQQQQQQQQQCADCSTESCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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