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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002695`

染色体: Chr01 坐标: 45211712-45216382 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002695`
名称	SmilChr01G002695
描述	derlin-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45211712 - 45216382 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985973`
GeneID	`130985973`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985973`
原始查询	`LOC130985973`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	derlin-1
产物	derlin-1
Arabidopsis	`AT4G29330` (DER1) DERLIN-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829054] identity=68.2; qcov=1.1; evalue=2.26e-122; confidence=high
Rice	`Os05g0187800` (OsDER1) - identity=64.2; qcov=1; evalue=2.87e-107; confidence=high
GO	GO:0000839 (Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0030433 (GO:0030433); GO:0030968 (endoplasmic reticulum unfolded protein response); GO:0051787 (misfolded protein binding); GO:1990381 (ubiquitin-specific protease binding)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04511 (DER1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985973

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057765210.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057765210.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765210.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765210.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45213305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B40
`Chr1:45214680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:45215705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A14,A16,A18,A19,A22,B102,B120,B126,B130,B135,B45,B46,B64,B81,B83,B85,B90,B92,B94,C1,C24,C27,C42,C43,C45,C53,C54,C59,C6,C63,C67,C70,C86,C9
`Chr1:45215736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C64,C66
`Chr1:45215781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B19
`Chr1:45215800`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A15,A19,A20,A22,B1,B22,B27,B28,B3,B30,B41,B42,B43,B49,B67,B68,B7,B98,B99,C1,C16,C17,C18,C19,C2,C29,C30,C32,C42,C48,C68,C83,C85,C87,D11
`Chr1:45215807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:45215808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765210.1

261 aa

130

261

DER1

PF04511 DER1 11-198 aa

XP_057765218.1

239 aa

120

239

DER1

PF04511 DER1 11-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765210.1`	Pfam	`PF04511`	DER1	Domain	11	198	1.7e-45	156.1	Der1-like family
`XP_057765218.1`	Pfam	`PF04511`	DER1	Domain	11	198	1.1e-45	156.7	Der1-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909235.1
TAATAATAATAATTTCTGTAAATGGAAAGTTATTGTTAATATCGATCTTATTTTTTTTTTTAATATTCAGTCAAGAACAACGTATACGATAATACGAAGGTTCTGGGTATTACTACACAACCTGGAATTCGTCTCATTTATTAATTTCTCTCTCTCTCCCTTCTTGGTTAAGCAAATCCTCTCCCTGCACTATTCTAACACCCTATACGCGCCCGCTGAAAAATTTTCAGTTTCCGATTTTGGCCGGATCGTCTATGCTG...

XM_057909227.1
TAATATCGATCTTATTTTTTTTTTTAATATTCAGTCAAGAACAACGTATACGATAATACGAAGGTTCTGGGTATTACTACACAACCTGGAATTCGTCTCATTTATTAATTTCTCTCTCTCTCCCTTCTTGGTTAAGCAAATCCTCTCCCTGCACTATTCTAACACCCTATACGCGCCCGCTGAAAAATTTTCAGTTTCCGATTTTGGCCGGATCGTCTATGCTGCTGGTTATCTGTTCGATCGAACTCGTTTTCTAGATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985973
ATGTCTTCCCCTGCTGAATTTTATCAGTCGCTTCCACCTATAACTAAAGCTTATGGGACTGCATGCTTAGTGGTCACTGTTGTATGTCAAATTGGGCTACTCAGTCCTGCAGACATTGCATACTTCTCAATCTTGGATTGGCAGGTCTGGCGACTAATTACCAACTTCTTTTTTCTTGGCAAGTTTTCTATCAATTTTGGGATTCGGCTCTTAATGATTGCAAGATACGGAGTTCAACTGGAAAATGGGCCATTTCAGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765210.1
MSSPAEFYQSLPPITKAYGTACLVVTVVCQIGLLSPADIAYFSILDWQVWRLITNFFFLGKFSINFGIRLLMIARYGVQLENGPFQRRTADFLWMMLFGALSLLVLSIIPIFSSPFLGISLVFMLLYLWSREFPNANINLYGLVTLKAFYLPWAMLCLDVIFGSPIVPDLLGIIAGHLYYFLTVLHPLAGGKNILKTPAFMYPFVLLFNVIYQSITRIFAYVCWLTHWPMIHLAIWKCEIISLLFPGNLPCAGRYGCNKK...

XP_057765218.1
MSSPAEFYQSLPPITKAYGTACLVVTVVCQIGLLSPADIAYFSILDWQVWRLITNFFFLGKFSINFGIRLLMIARYGVQLENGPFQRRTADFLWMMLFGALSLLVLSIIPIFSSPFLGISLVFMLLYLWSREFPNANINLYGLVTLKAFYLPWAMLCLDVIFGSPIVPDLLGIIAGHLYYFLTVLHPLAGGKNILKTPAFIHKQVMKWRIGAPPPSSVAQQQDRATGVAFRGRSYRLGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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