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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001285`

染色体: Chr05 坐标: 11000546-11003333 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001285`
名称	SmilChr05G001285
描述	aspartic proteinase NANA, chloroplast
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11000546 - 11003333 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985984`
GeneID	`130985984`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985984`
原始查询	`LOC130985984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase NANA, chloroplast
产物	aspartic proteinase NANA%2C chloroplast
Arabidopsis	`AT3G12700` (NANA) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820452] identity=46.7; qcov=1; evalue=7.74e-146; confidence=high
Rice	`Os05g0557100` - identity=50.8; qcov=0.859; evalue=1.51e-126; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985984

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057765221.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057765221.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765221.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765221.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11001094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:11001169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B125,B4,C26
`Chr5:11001220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B17,B41,C46
`Chr5:11001331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C22,C41,C74,C76
`Chr5:11001346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B12,B27,C2,D10
`Chr5:11001346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B27,C2,D10
`Chr5:11001388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B107,B27,B88,C24
`Chr5:11001441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B107,B27,B88,C24
`Chr5:11001467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B83,C40,C47,C76
`Chr5:11001521`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C3,C37,C61
`Chr5:11001521`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C3,C37,C61
`Chr5:11002405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B88,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765221.1

468 aa

234

468

Asp

TAXi_N

TAXi_C

PF00026 Asp 107-464 aa PF14543 TAXi_N 108-289 aa PF14541 TAXi_C 314-463 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765221.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	107	464	9.3e-18	65.4	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057765221.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	108	289	5.7e-46	157.6	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057765221.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	314	463	5.6e-35	121.2	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909238.1
GTGTACGTAACAGCAAAGGGTCGAACATTAGATCCCAACGATCATGTGAAGAGAGAGATAGAATAATTGATATGATGGAGAAAAAGAATAGAGAGAGAAAGGCAGAGCCAAGACAAGGACGTACTGTGTGATAAATCAACCATGCTCGAAGACAGCCCACAATAAATAAAGGCTTTAAATAAAACTGATAAATATGCATGTATGACAGAGCGATAGGAAAACCAAGAAAGGCTTTAGAAAAATAAATGGAGACTCCAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985984
ATGGTTACGTGCCACACGCACCCACTCCTTTTCATCTTATTTCTCTCCTTCGTTATTGCTAATTCTGCCGAGGCCGAGGGCGGGGTAAAATTTCAGCTGATTCGCCGCCGCGATCTGCTTCCCAGAGGGGTGGAGCGGCTGCGGCAGTTAGTCCGCAGCGACACGGCTCGCGTGCGCGGGATATCAAGGAGAGTTAACGTTAGGCGCCAAATCCGAGAGAATGTGTACGAGCCGGCCTGCAACAATGGGAGCCGCGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765221.1
MVTCHTHPLLFILFLSFVIANSAEAEGGVKFQLIRRRDLLPRGVERLRQLVRSDTARVRGISRRVNVRRQIRENVYEPACNNGSRGKDQHASGELPMHSGADNGVGQYLVKLRVGSPSQKLVLIADTGSDLTWSNCRYKCPGGRCARQRRRVFRADLSSSFRTVPCSSTICKTDLANLFSLSSCPSPLDPCSYDYRYSDGSATVGVFGNESVTLRLSNGRKARLHDVLVGCSESARGQSFVAADGVMGLGYSNYSVAVKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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