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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001288`

染色体: Chr05 坐标: 11015002-11016709 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001288`
名称	SmilChr05G001288
描述	metacaspase-4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11015002 - 11016709 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985985`
GeneID	`130985985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985985`
原始查询	`LOC130985985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metacaspase-4
产物	metacaspase-4
Arabidopsis	`AT1G79340` (MC4) metacaspase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844272] identity=66.6; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0799900` (OsMC6) - identity=62.1; qcov=1.03; evalue=3.9e-173; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00656 (Peptidase_C14); PF31181 (Pept_C14_Metacaspase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765222.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765222.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765222.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765222.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765222.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11015354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:11015460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:11015700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:11015751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B88
`Chr5:11015925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:11016027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B140,C2
`Chr5:11016150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765222.1

407 aa

204

407

Pept_C14_Metacaspase

Peptidase_C14

PF31181 Pept_C14_Metacaspase 3-146 aa PF00656 Peptidase_C14 3-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765222.1`	Pfam	`PF31181`	Pept_C14_Metacaspase	Domain	3	146	6.3e-44	150.9	Metacaspase, peptidase C14 domain
`XP_057765222.1`	Pfam	`PF00656`	Peptidase_C14	Domain	3	397	6.1e-43	147.9	Caspase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909239.1
AAATGGCCCCTACGCGTGCGCGTGCCGACACTGTGCAAATTGCAATCCTCTTCTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCCAATCAACTGTATGTGGAAAAGACTTTCTCATCCTTCCTTATTTAAAATTGGAGTATATACTCTCACCATCTTGATCCAATCAAGCTTTTTTCAACCTTAACCATGGCGAAGAAGGCTGTTCTGATCGGCTGCAACTACCCTGGGACCAAGGCGGAGCTCAAGGGATGCATCAACGACGTGCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985985
ATGGCGAAGAAGGCTGTTCTGATCGGCTGCAACTACCCTGGGACCAAGGCGGAGCTCAAGGGATGCATCAACGACGTGCGGCGGATGCACGATTGCCTCATCGACCGTTACGGCTTCTCGGAGGATGACATCACCGTCCTCATCGACACCGACGATTCCTACAAGCAGCCCACTGGCCACAACATACGCGCCGCGCTCTCCGATCTCGTCGATTCCGCCCGCCCCGGTGACTTCCTCTTCGTCCACTACAGTGGCCACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765222.1
MAKKAVLIGCNYPGTKAELKGCINDVRRMHDCLIDRYGFSEDDITVLIDTDDSYKQPTGHNIRAALSDLVDSARPGDFLFVHYSGHGTRLPAETGEEDDTGYDECIVPTDMNLITDDDFRDLVDKVPSGCQITIVSDSCHSGGLIDEAKEQIGESHRKSGEEEEEEEKDSGGFRNFLRRSVGDAIESRFGRRKDDQEEAIEESEESEGIKNKSLPLSTLIELLKQKTGKEDIDVGKLRPTLFDVFGEDASPKVKKFMNFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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