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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001314`

染色体: Chr05 坐标: 11317416-11320264 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001314`
名称	SmilChr05G001314
描述	phosphoglycerate kinase, cytosolic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11317416 - 11320264 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986015`
GeneID	`130986015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986015`
原始查询	`LOC130986015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoglycerate kinase, cytosolic
产物	phosphoglycerate kinase%2C cytosolic
Arabidopsis	`AT1G79550` (PGK) phosphoglycerate kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844293] identity=88.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0668200` (PGK) - identity=86.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004618 (phosphoglycerate kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006094 (gluconeogenesis); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00162 (PGK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765260.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765260.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057765260.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765260.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11318827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:11319240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:11319964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:11320069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765260.1

401 aa

200

401

PGK

PF00162 PGK 10-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765260.1`	Pfam	`PF00162`	PGK	Domain	10	390	5.8e-168	559.4	Phosphoglycerate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909277.1
ATTCAATTTCTTTTACCGAAATGGAAAAATGCAAACCTGGTCGGCTGGTCCCATGTAGCATAATGCGCTTAACCTACGCCTTAACTTTACATATAAAACTAAAACCCTCTCGATTCTTCCACTCTCCATCTGCTCGTGACTGATCTCTTTGCTTCGATCCATTCATTGATTTATATCAACAATTTCGATCTGAAAATGGCGACGAAGAAGAGTGTGGGCTCGCTCAAGGAAGCCGATCTGAAGGGTAAGAAAGTTCTAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986015
ATGGCGACGAAGAAGAGTGTGGGCTCGCTCAAGGAAGCCGATCTGAAGGGTAAGAAAGTTCTAGTCAGAGCGGATCTGAACGTGCCATTGGATGATAACTTCAACATTACCGATGATACCAGGATCAGAGCCGCCGTCCCCACCATTAAGTATTTGATCGGATATGGTGCTAAAATTATCCTCACTTCTCACCTTGGCCGTCCAAAAGGTGTCACGCCAAAATACAGTTTGAAGCCTCTCGTTCCTAGACTATCTGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765260.1
MATKKSVGSLKEADLKGKKVLVRADLNVPLDDNFNITDDTRIRAAVPTIKYLIGYGAKIILTSHLGRPKGVTPKYSLKPLVPRLSELLGLEVKMANDCIGEEVEKLVAGLPDGGVLLVENVRFYKEEEKNDPEFAKKLASLADLYVNDAFGTAHRAHASTEGVTKYLKPSVAGFLMQKELDYLVGAVSNPKKPFAAIVGGSKVSSKIGVIESLLSKVDVLILGGGMIFTFYKAQGLAVGSSLVEADKLDLATSLMEKAKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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