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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001315`

染色体: Chr05 坐标: 11320858-11323001 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001315`
名称	SmilChr05G001315
描述	uncharacterized SmilChr05G001315
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11320858 - 11323001 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986016`
GeneID	`130986016`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986016`
原始查询	`LOC130986016`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0511700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0511700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G16445` (AT1G16445) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838215] identity=57.9; qcov=0.785; evalue=9.84e-88; confidence=high
Rice	`Os05g0511700` - identity=55.4; qcov=0.775; evalue=9.61e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06962 (rRNA_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986016

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765261.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057765261.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057765261.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765261.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765261.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11321327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:11321481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B67,C51
`Chr5:11321489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B140,D4
`Chr5:11322604`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C82
`Chr5:11322604`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C82
`Chr5:11322608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:11322658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D11
`Chr5:11322716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B137,B44,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765261.1

275 aa

138

275

rRNA_methylase

PF06962 rRNA_methylase 133-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765261.1`	Pfam	`PF06962`	rRNA_methylase	Family	133	272	1.1e-39	136.2	Putative rRNA methylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909278.1
CTCACGCACGGTTAGCTTGTGTTTTGGCGTGTGTAATATGAACGATGGTCGATACGGCTTTAGAAAAAAAAAACAAAAAAAACTTTGCTGTTTGCCAAACACTTTCCATTTACCAGAAAAGCCCAAAAAGAAGTGATAATCCTATTTCTTAGAAGAAACGAAAAAAAAAAAACAGAAATAGAGTTTGAGAACCCTATTGTAAGTCTGTAAAAGATAATCCCGTGAAAAAGGGAAGCGAGAAAAAACACAAAGGAGAGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986016
ATGGCTATGATGAGATGCTGCCCAAATCCATACCCTTCAGCGACCCGCAAGATTACTCAACTGTACAACAATCTCAACCTCTTCCGCTCCACTCCGCCGCCGTTATCGTCCACAAAGTTACGCTCTGTCTCAGTACTATCATCAATCTCGACGCATTCCGTTGCTCACGACGATCTTCAAGCTCCCTCTTCCAAGCACAATGCCTCCCCCTTTTCAGGTTTGGATGAGATGATGACGGGATTCATATTCGGGAAGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765261.1
MAMMRCCPNPYPSATRKITQLYNNLNLFRSTPPPLSSTKLRSVSVLSSISTHSVAHDDLQAPSSKHNASPFSGLDEMMTGFIFGKKKATEVAHAVWKNVVRKGDMVIDATCGNGYDTLAMLRLVADDEGRGRVFAMDLQKSALESTSSLLDRSLTPHQRGLVELYAMCHTKMEDLVPSGAAVRLVAFNLGYLPGGDKKIKTESETTLVALEAAKRILARGGLISILAYVGHFGGREEFEKVRSFAAELDVDNWVCCTLQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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