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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001319`

染色体: Chr05 坐标: 11339483-11345731 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001319`
名称	SmilChr05G001319
描述	proteasome subunit alpha type-2-A
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11339483 - 11345731 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986018`
GeneID	`130986018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986018`
原始查询	`LOC130986018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteasome subunit alpha type-2-A
产物	proteasome subunit alpha type-2-A
Arabidopsis	`AT1G16470` (PAB1) proteasome subunit PAB1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838217] identity=91.1; qcov=1; evalue=3.3e-160; confidence=high
Rice	`Os03g0387100` (TT1) - identity=90.6; qcov=1; evalue=5.12e-159; confidence=high
GO	GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0019773 (proteasome core complex, alpha-subunit complex)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00227 (Proteasome); PF10584 (Proteasome_A_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765266.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765266.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765266.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765266.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765266.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11340161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B137,B44
`Chr5:11341857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B54,C35,C44
`Chr5:11342568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr5:11345380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,C64,C66,D10
`Chr5:11345519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765266.1

235 aa

118

235

Proteasome_A_N

Proteasome

PF10584 Proteasome_A_N 6-28 aa PF00227 Proteasome 31-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765266.1`	Pfam	`PF10584`	Proteasome_A_N	Family	6	28	6.7e-09	36.0	Proteasome subunit A N-terminal signature
`XP_057765266.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	31	213	1.1e-58	198.8	Proteasome subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909283.1
TATCTGAATGGGCCTACACTTCACCCCAAAATCATCAAATATTCAGAATCGTCTTCTTCTCCTCCAAGAAACCACTATAAAGTGCCTTCCCTGCTCCGGCAATTCACACACTACTGCATTTCCGGGAGCTTATTTCACAAGTAATTTTCAGCTTGCTCATCTGGATTAGTAAAATTGTGTCGAGAAATCAATGGGTGATAGTCAGTACTCTTTCTCCCTCACCACTTTCAGCCCTTCAGGAAAACTTGTTCAAATCGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986018
ATGGGTGATAGTCAGTACTCTTTCTCCCTCACCACTTTCAGCCCTTCAGGAAAACTTGTTCAAATCGAACATGCTCTGACTGCGGTTGGATCTGCAACATCTTTGGGAATTAAAGCTGCTAATGGCGTTGTTATTGCAACTGAGAAGAAACTGCCATCGATTTTGGTTGATGAAACATCTGTGCAGAAAATTCAGATTTTGACGCCAAACATTGGAGTTGTATACAGTGGCATGGGCCCTGATTCTCGAGTTTTGGTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765266.1
MGDSQYSFSLTTFSPSGKLVQIEHALTAVGSGXTSLGIKAANGVVIATEKKLPSILVDETSVQKIQILTPNIGVVYSGMGPDSRVLVRKSRKQAEQYYRLYKEPIPVTQLVRETATVMQEFTQSGGVRPFGVSLLVAGYDDKGPQLYQVDPSGSYFSWKASAMGKNVSNAKTFLEKRYTEEMELDDAVHTAILTLKEGFEGQISGKNIEIGVIGSDRIFKVLSPSEVEDYLQEAE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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