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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002706`

染色体: Chr01 坐标: 45324190-45342867 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002706`
名称	SmilChr01G002706
描述	uncharacterized SmilChr01G002706
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45324190 - 45342867 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986040`
GeneID	`130986040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986040`
原始查询	`LOC130986040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0187400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0187400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G11700` (AT5G11700) ephrin type-B receptor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831042] identity=64.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0187400` - identity=65.2; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26010 (DUF8003)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765291.1`
2	Dendrite	Dendrite	0.20000	`XP_057765291.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057765300.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057765300.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45324511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C85
`Chr1:45324580`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr1:45324580`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr1:45324631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:45325675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:45326229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B21,C81
`Chr1:45326241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B46,D11
`Chr1:45326424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C64,C66
`Chr1:45326718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C79
`Chr1:45326730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B21,C81
`Chr1:45329346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B138,B80,C20
`Chr1:45329364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765291.1

1438 aa

719

1438

DUF8003

PF26010 DUF8003 795-867 aa

XP_057765300.1

1176 aa

588

1176

DUF8003

PF26010 DUF8003 533-605 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765291.1`	Pfam	`PF26010`	DUF8003	Domain	795	867	1.4e-35	122.2	Domain of unknown function (DUF8003)
`XP_057765300.1`	Pfam	`PF26010`	DUF8003	Domain	533	605	1.1e-35	122.6	Domain of unknown function (DUF8003)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909308.1
ACCGAGAGACATTCACATTCTTGGATGAAAATGAAAGCCGGAGCAAATTCCCGAACTCCTCGCTCTCTCTCTCTACACTCTCCACCTGTTCCCCCTCTCTCTCTCCATCTATACATGCAAAGCAACACCTATACGATCCATTCTCTTCTTCTCGCTGATGAACTTTCATGGCCGCCCGATTTCCCATGCTTCTCTATTCTTCCATTTTCCTCTTCTTCGCTGCTGCTTCCACTCCATCTGCACTCGCCTCGCGCGCCGAT...

XM_057909317.1
GAGGATTTGGTTGGAGGCGGCCGACGTCGTAGACATGCATGGGACGCTTTTGGCGGATGGAGGGGATGGTGGGGTCAAAGGTGGTGGAGGCTCCGGTGGCAGCATTTACATCACCTCAAAGAAAATATTTTGCAGTTCGGCTTAGAGAGAGGATAATCCAGTTTTAGACTTGGTGTAGTGAGCTGAGCATGATTACTACATGTATTCCATCTTCAGAGGACGCATTAAGGACAGGAAGTGGCATTGTAAGTGCATCTGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986040
ATGGCCGCCCGATTTCCCATGCTTCTCTATTCTTCCATTTTCCTCTTCTTCGCTGCTGCTTCCACTCCATCTGCACTCGCCTCGCGCGCCGATTTCTCCATCATAGACTACGGCCGCTCGCCCAAGCTATTCCGGGGCGGTTACACGCCGCCGTCCCCGCCTCCGCCGTCGCCGCCGCCCCACCCGCCTCCCCTCACCTGCGAGGATTTGAAGGGCATCGGCTCGCTCAACACCACCTGTGAGCTCAACACCAACTTGAA...

LOC130986040
ATGATTACTACATGTATTCCATCTTCAGAGGACGCATTAAGGACAGGAAGTGGCATTGTAAGTGCATCTGGAGGTAATGGATTTGCTGGAGGTGGTGGTGGAAGAGTATCTGTTGATGTATTCAGCAGGCACGATGACCCCATATTCTTGGTACATGGGGGAAGAAGCTTTGGCTGCCCCAGGAATGCAGGTGCTGCTGGGACATTCTTTGATGCTGTTCCTCGAAGACTTATAATCAACAACAGCAATATGTCAACAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765291.1
MAARFPMLLYSSIFLFFAAASTPSALASRADFSIIDYGRSPKLFRGGYTPPSPPPPSPPPHPPPLTCEDLKGIGSLNTTCELNTNLNFTDDVYIEGRGNFYVLQGVALICPQIGCSIVINVTGEFILKSFVEIVAGSVYIVAGNASVLGGSLINVTARAGAPPEPATGTPDDAQGGGGGHGGGGASCVMDNKKLPEEIWGGDAYAWDSLDKPWSYGSKGGTTKREEDYGGGGGGRIWLEAADVVDMHGTLLADGGDGGVK...

XP_057765300.1
MITTCIPSSEDALRTGSGIVSASGGNGFAGGGGGRVSVDVFSRHDDPIFLVHGGRSFGCPRNAGAAGTFFDAVPRRLIINNSNMSTDTYTLLLQFPNQPLWTNVYVQNRAQATVPLLWSRVQVRGQLSLSRESTLSFGLVHYAFSEFELMAEELLMSDSIIKVYGALRMSVKIHLMLNSKMLIAGESDAIVATSLLEASNLVVLKGSSMIHSTANLGLHGQGSLNLSGPGDVIEAQHLVLSLFYAISVGPGSVLRGPLKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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