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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001360`

染色体: Chr05 坐标: 12100982-12103878 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001360`
名称	SmilChr05G001360
描述	protein Iojap, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12100982 - 12103878 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986054`
GeneID	`130986054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986054`
原始查询	`LOC130986054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein Iojap, chloroplastic
产物	protein Iojap%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G12930` (AT3G12930) Lojap-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820478] identity=64.5; qcov=0.955; evalue=7.71e-90; confidence=high
Rice	`Os09g0493600` - identity=64.2; qcov=0.683; evalue=4.26e-66; confidence=high
GO	GO:0017148 (negative regulation of translation); GO:0043023 (ribosomal large subunit binding); GO:0090071 (negative regulation of ribosome biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF02410 (RsfS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765307.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057765307.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765307.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765307.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12102766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C70
`Chr5:12103491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B127,B35,B37
`Chr5:12103517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C62
`Chr5:12103530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:12103586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B44,C2,C77
`Chr5:12103595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:12103638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B79
`Chr5:12103651`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B131,B139,C68
`Chr5:12103651`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B131,B139,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765307.1

221 aa

110

221

RsfS

PF02410 RsfS 103-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765307.1`	Pfam	`PF02410`	RsfS	Domain	103	213	9.8e-27	93.8	Ribosomal silencing factor during starvation

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909324.1
TATAAATTATTTGGTCAAGAAAAGAAAGGCCCAACCCATTAACGTATCTCACTTAGGATGAGATTTTGTTGTAGGTGATTCTATCTCACTTCTCACCGCACCAAAACATTTTTGATTATTCCCAACAAAAAATCTCTCCGCTTCTCAAATTCTGGTAAATTTTCGTCGGCGCACTTTCAACAATTAATGTTATAATTTTGTGGAAATGATAATCCTTCACCATCCCATTCTTCCTTCTTGCACCAAATCCTCCACTCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986054
ATGATAATCCTTCACCATCCCATTCTTCCTTCTTGCACCAAATCCTCCACTCCCGGCGGCCATTTCCGGCGAAAGTCTGAGCTTTTTCGGAGTCACAAAAAGCTTTCTATATCTAATGGAACCGGTTTCCAATATTTACGGATGAGTAGCGCTCAGGAGCATTTTCTGCCACCCTTGGCCGTCGGCTCGAATGTGAGTGAAGATACTGACGATATGTATGACGACTTATTCGAGAAGTATGGAAAGGTGGTCTTCAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765307.1
MIILHHPILPSCTKSSTPGGHFRRKSELFRSHKKLSISNGTGFQYLRMSSAQEHFLPPLAVGSNVSEDTDDMYDDLFEKYGKVVFKRNDQKAVREEVDDDAESLTFAVALAKVASDVKAADIKLLFVKPLVYWTRFFIIATAFSRPQVDAIGSRIRHLAESKYGRTATGDFKPNSWTLLDFGDVVVHIFLPPQRDHYNLEEFYANATPIELPFEDQQPFRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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