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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001368`

染色体: Chr05 坐标: 12145860-12147998 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001368`
名称	SmilChr05G001368
描述	uncharacterized SmilChr05G001368
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12145860 - 12147998 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986062`
GeneID	`130986062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986062`
原始查询	`LOC130986062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine repetitive matrix-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842053]; symbol=AT1G56020; hit=AT1G56020; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	serine/arginine repetitive matrix-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842053]; symbol=AT1G56020; hit=AT1G56020; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G56020` (AT1G56020) serine/arginine repetitive matrix-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842053] identity=45; qcov=1.04; evalue=2.64e-77; confidence=medium
Rice	`Os06g0675200` - identity=39.2; qcov=0.962; evalue=1.21e-55; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765315.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057765315.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765315.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765315.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765315.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12146382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr5:12146440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:12146491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B30,C36
`Chr5:12146500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C62
`Chr5:12146513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C62
`Chr5:12146584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C62
`Chr5:12146815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B49,B54
`Chr5:12146907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:12147058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:12147298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:12147462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C24
`Chr5:12147466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909332.1
GTCCCTTAAGTTTATGATAATAGCGGTGAGACCCCTCGGCAGGATGCTTCCAAGAACCATCATCAAAAACGATCTCCGCTGCCCGTCACGTCAACCTTGCTTTGACCGACTGGACACGTGGCTTTTCCCCATTGGATCAGAAGGGGGACCCCACCCGTACGATTGTTTCTATTTATGTGTACCCTGTACTCGGCCCGCTGGGGCACACACTAGTACACTTCCTCCACGCACACTATTCACTTTGAGATTGAGATTGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986062
ATGGCATCGGCGTGCGTGAACAATATCGGAATGTCGCCGGAGAGCTTCCTCGACTGTCCTCCGGCGGCTTTCCCTTCATATGGCTGGCTGAGCCCGAGGATATCGTTCAGCCGCGAGTTTCCCGACGAAGACGCATCCAAAGTCGCCGTCAATAGGTCGTCTCCGAAGCGGCTGCCGATGCCGCACAATGCGGATGAGGAGAAGCTGGAAGAGCCAGATCCGGAGGTCTCCAGCAAGGATTTCGTTGATTTCGAGTTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765315.1
MASACVNNIGMSPESFLDCPPAAFPSYGWLSPRISFSREFPDEDASKVAVNRSSPKRLPMPHNADEEKLEEPDPEVSSKDFVDFEFRLEDPVAMLPADELFADGKLVPLQLSSIRHSMTSVPVFSEARSPDTPNYRRRNEISSRDPYLFSPKAPRCSSRWKELLGLKKLYQNSNVKQEDPRTASALSSNSHNKNSARGLKHLLQRSSKSSLNTSIDSSLNQPLLKDSDNESISISSRLSLSSSSSGHEHDDLPRLSLDSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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