当前解析结果
SmilChr05G001397| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001397 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001397 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001397 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 12545674 - 12547515 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986088 |
|---|---|
| GeneID | 130986088 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986088 |
| 原始查询 | LOC130986088 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986088 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057765351.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057765351.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765351.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765351.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057765351.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:12547185 |
G |
GAT |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 2 | B124,B8 |
Chr5:12547185 |
G |
GAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B124,B8 |
Chr5:12547189 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B125 |
Chr5:12547191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B16,B95,C29,C54 |
Chr5:12547229 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B82,D5 |
Chr5:12547230 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B61,B90 |
Chr5:12547257 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr5:12547269 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B61,B90 |
Chr5:12547270 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B61,B90,D4 |
Chr5:12547278 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B61,B82,B90,D5 |
Chr5:12547357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。