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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001399`

染色体: Chr05 坐标: 12589182-12590243 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001399`
名称	SmilChr05G001399
描述	PRA1 family protein G2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12589182 - 12590243 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986091`
GeneID	`130986091`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986091`
原始查询	`LOC130986091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein G2
产物	PRA1 family protein G2
Arabidopsis	`AT5G56230` (PRA1.G2) prenylated RAB acceptor 1.G2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835722] identity=49.2; qcov=0.968; evalue=1.24e-52; confidence=high
Rice	`Os05g0474400` (OsPRA1) - identity=41.2; qcov=0.783; evalue=1.88e-25; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986091

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057765356.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057765356.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057765356.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057765356.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057765356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12589460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B104,C24,C61
`Chr5:12589585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B42,B43,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765356.1

189 aa

189

PRA1

PF03208 PRA1 31-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765356.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	31	170	2e-38	131.9	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909373.1
ATATTATCCAATAGTTTTGTAAAATTTTATTTAATCCACCTCAAATTGTCGAAATTCGAAATTTTGAGCAAGAAGATAGGTTGTGTTGGTTTAGGTTTTGGTTTTGGTTTTGGGCCAGAGACGCTAATTCGAAACATTTTTGGTTTAGGGCCGAATAAACGTGGCGACCACTCGTCCTGTAAATCCAAACCTACTCGGCTAACAAACAAACATATCACGACGCAGCGAGATCTACCGAGGTTGACCCGCAAACATTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986091
ATGCCCTCCTCCCCCGCCGCCGCGACCTACACCACAATCCCGATTTCCGGCATCGACGTCATTTTCCGATCGACGCAGAACCTCTCCGCCTCCCTCTCTCGCTGCCGCCCCTGGCCGGAGTTCCTGTCGGGCCTGGACCTCCCGCCCTCCCTCTCCGCCGCGTCCCTTAGGTTCCGGCGCAACGCTGCGTACTTCTCCCTAAACTACGCCATAATCGTGAGCGCGTGCGCCGCCGTGTCGCTCATCACCACGCCTCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765356.1
MPSSPAAATYTTIPISGIDVIFRSTQNLSASLSRCRPWPEFLSGLDLPPSLSAASLRFRRNAAYFSLNYAIIVSACAAVSLITTPLALIVLGFVLFLWLIFHFFREDPLLIWGRHVSDWAVIAGLVMLSILALWITGPLHNLSIGIIVGLLISSIHGVLRNPEGLFLDENDAVSTGLIATAGPSFTPPL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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