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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001403`

染色体: Chr05 坐标: 12617129-12617818 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001403`
名称	SmilChr05G001403
描述	photosystem I reaction center subunit V, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12617129 - 12617818 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986095`
GeneID	`130986095`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986095`
原始查询	`LOC130986095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem I reaction center subunit V, chloroplastic
产物	photosystem I reaction center subunit V%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G55670` (PSAG) photosystem I subunit G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842016] identity=77; qcov=0.946; evalue=6.64e-68; confidence=high
Rice	`Os09g0481200` (PsaG) - identity=65.1; qcov=0.993; evalue=2.37e-59; confidence=high
GO	GO:0009522 (photosystem I); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0015979 (photosynthesis)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01241 (PSI_PSAK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986095

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765360.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057765360.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057765360.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765360.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765360.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12617323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:12617490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:12617599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765360.1

147 aa

147

PSI_PSAK

PF01241 PSI_PSAK 51-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765360.1`	Pfam	`PF01241`	PSI_PSAK	Family	51	141	2.1e-22	79.6	Photosystem I psaG / psaK

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909377.1
AATCTGTGATCCAGACATAACCAATGAGGCGGAGCCAGATCAGCATGCATAATCTTAGTAGCGCCACTCCAATTCGCTCCCCTCCTCACAAAAATCCCTGCCATCATCTCTCTAATTATAAACCTCATCTTTGATTAATCCATCCCTCACCTTCACCTCACTTCCAATCCAATCCAATCCAAATCAAATCCAATCTGCAATGGCCTCCGCCTTGTTCTCCGCCCCAAGCTTCCAAGGCCTCCGGCCTCTGAACAAGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986095
ATGGCCTCCGCCTTGTTCTCCGCCCCAAGCTTCCAAGGCCTCCGGCCTCTGAACAAGGCCACCGACTCCTCCGTGGTCCTCTCGAAGCCGGCGTCCGCCGCCTTCCGCCGCGGCAGCAGCAAGCGCGGCCTGGGCGTGAAGGCGGAGCTGAACCCGTCGCTGGTGATAAGCCTGAGCACGGGGCTGTCCCTCTTCCTAGGCAGGTTCGTGTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACGTGGCGAAGCAAGTGCCGGAGCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765360.1
MASALFSAPSFQGLRPLNKATDSSVVLSKPASAAFRRGSSKRGLGVKAELNPSLVISLSTGLSLFLGRFVFFNFQRENVAKQVPEQNGISHFEAGDVRAKEYVSLLKSNDPVGFNIVDVLAWGSIGHIVAYYILATSSNGYDPSFFG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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