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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001406`

染色体: Chr05 坐标: 12632497-12639177 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001406`
名称	SmilChr05G001406
描述	actin-related protein 8
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12632497 - 12639177 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986098`
GeneID	`130986098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986098`
原始查询	`LOC130986098`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-related protein 8
产物	actin-related protein 8
Arabidopsis	`AT5G56180` (ARP8) actin-related protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835717] identity=66.5; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0667700` (OsFbox236) - identity=50.7; qcov=0.429; evalue=1.54e-60; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00022 (Actin); PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765363.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765363.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057765363.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765363.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12632717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,D9
`Chr5:12632828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:12634382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:12637468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:12637520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,D10
`Chr5:12637824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:12638377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765363.1

478 aa

239

478

F-box

F-box-like

Actin

PF00646 F-box 48-89 aa PF12937 F-box-like 48-89 aa PF00022 Actin 221-468 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765363.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	48	89	2.8e-09	37.2	F-box domain
`XP_057765363.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	48	89	1.6e-09	38.1	F-box-like
`XP_057765363.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	221	468	6.3e-35	121.3	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909380.1
GGTTGCAGATTCCAGGGTTCTTATAACGGACACGTGTCAGAAGTCTGCGATGCCTCCAGTCGCTTTCACTTTCGAAGATCGTCAAACCTCCGCCCACCAGAAATCCAAAATTGTGCTCGCCAAATCTAATCTAAGCGATGATAAAATTCAATTAATTCCTGCCTAATCCAGTTCCAGTTGTGATGCCATGAGCGCTCTGATTCGCAAGGTTTGGGAATCGGTCGCCCACCGAGCGGGCTCCGGCTACAAATCCAACCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986098
ATGAGCGCTCTGATTCGCAAGGTTTGGGAATCGGTCGCCCACCGAGCGGGCTCCGGCTACAAATCCAACCCGAACCCGAACCATGCATCCGAGTACGACCGCTTCCTCCATATGTATATTCAGTCGTCGTCGACCGGCGAGTTCGACCGGATTCCCATCGACATCTTCATGCAGATTCTCAAAATTCTCGGCCCAAAGGAGTCGGCACGGCTGAGAGCGGTCTGCAAATCGTGGAAATTTTTGGTGTCGGATAATCGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765363.1
MSALIRKVWESVAHRAGSGYKSNPNPNHASEYDRFLHMYIQSSSTGEFDRIPIDIFMQILKILGPKESARLRAVCKSWKFLVSDNRLWIYFLQHQPEPWDSVFFAETHLRSGYPLQVFPAQMHDLSFMHVHGQRVEVPGALIIDGGSGYCKYGWSKYSSPSGRSATFLEFGNIESPMPSRLRHFFSTICNRMQVKTSTQPIVVSIPLCHYDDTESAKGSRRQLKDAIYSTLFDMNVPAVCAINQATLALFAARRTSGILV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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