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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002709`

染色体: Chr01 坐标: 45349054-45350040 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002709`
名称	SmilChr01G002709
描述	40S ribosomal protein S30
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45349054 - 45350040 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986110`
GeneID	`130986110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986110`
原始查询	`LOC130986110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S30
产物	40S ribosomal protein S30
Arabidopsis	`AT2G19750` (AT2G19750) Ribosomal protein S30 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816494] identity=96.8; qcov=1; evalue=6.32e-30; confidence=medium
Rice	`Os02g0804100` (OsRPS30) - identity=100; qcov=1; evalue=4.15e-39; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04758 (Ribosomal_S30)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765387.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057765387.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765387.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765387.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45349218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C14,C74
`Chr1:45349703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B107,B110,B117,B17,B3,C49
`Chr1:45349707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:45349720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:45349721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B17,B3,C41
`Chr1:45349745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B17,B3,C41
`Chr1:45349748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B107,B117,B3,C49
`Chr1:45349748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B117,B3,C49
`Chr1:45349767`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,B110,B26,B48,B61,B88,C14,C21,C76,C77
`Chr1:45349784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B3,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765387.1

62 aa

Ribosomal_S30

PF04758 Ribosomal_S30 3-59 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765387.1`	Pfam	`PF04758`	Ribosomal_S30	Family	3	59	9.6e-31	106.5	Ribosomal protein S30

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909404.1
AAGGCCCAACAATACTTGCCCATATTATATATACTGGTCTCCACAAACTAAACCCTAACCCAATCGCCGAAGCCATTCACGCCAAAGACGGAGAAATATCTCTCGATCGGAGAAAATTCGAGCTAAATCATGGGTAAGGTACACGGATCGTTGGCTCGCGCCGGAAAGGTGAGAGGACAGACTCCCAAGGTCGCCAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCCCGCGGCCGCGCTCACAAGCGGATGCAGTACAACCGCCGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986110
ATGGGTAAGGTACACGGATCGTTGGCTCGCGCCGGAAAGGTGAGAGGACAGACTCCCAAGGTCGCCAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCCCGCGGCCGCGCTCACAAGCGGATGCAGTACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGAAAGAAGAGGGGGCCTAACTCATCCGAGAAGTAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765387.1
MGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQDKKKKPRGRAHKRMQYNRRFVTAVVGFGKKRGPNSSEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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