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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001439`

染色体: Chr05 坐标: 13140451-13142270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001439`
名称	SmilChr05G001439
描述	uncharacterized protein At4g26485-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13140451 - 13142270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986130`
GeneID	`130986130`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986130`
原始查询	`LOC130986130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyltransferase small domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723141]; symbol=AT4G26485; hit=AT4G26485; species=arabidopsis; confidence=high
产物	methyltransferase small domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723141]; symbol=AT4G26485; hit=AT4G26485; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G26485` (AT4G26485) methyltransferase small domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723141] identity=47.6; qcov=0.644; evalue=6.7e-58; confidence=high
Rice	`Os09g0479300` - identity=41.5; qcov=0.625; evalue=4.12e-43; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0070042 (rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase activity); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	-
Pfam	PF10354 (BMT5-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986130

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765398.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057765398.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765398.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765398.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13140569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C71,D11
`Chr5:13140655`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr5:13140655`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr5:13140883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,B8
`Chr5:13140907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B55,B57,B90,B92
`Chr5:13140951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13141188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B119,B23
`Chr5:13141236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:13141244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:13141425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B50,B60
`Chr5:13141626`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B136,C37
`Chr5:13141626`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B136,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765398.1

320 aa

160

320

BMT5-like

PF10354 BMT5-like 133-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765398.1`	Pfam	`PF10354`	BMT5-like	Domain	133	299	1.4e-48	166.1	rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase BTM5-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909415.1
GGTGGCTTTAAATCGTACGGAGCTATGAAATACTCGAAATTACGACTGTGGCACTGCCAACTACCAAAAGCGAGTAGAAAATGATTCGTCTTCGTCAGCGTCTTTGATTTCTAGTCTTCGCCTCCAAGTCTTCTGCACTCTGTTTAAATCTACCTGATCTCTCTCTCTCTCAGAGGATGGTTTAGTTTACAGTCCATTTGATGATGATCGGTGGTTGCATCTCGAGCTCCAACCTTACTCATCAGGTGTGGTTTCTCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986130
ATGGGAATTCTTCAGAGCAGCTGCAGAGCCAAAGAAGAAGAAGATGAAATCCCAATTTATCCAGATTTCCAGAATCATTATATATCTTGGTCGCCTAAACTATTAAAACTGAGCATTTTGATCTACAAAGCTTTAAAAGGCATCTTGCGGAAAATTGGTTCCATCTTCTCTGATGCAGAGCCATTACTCCCGGTTCCAAATCCGGCATCACGCGGCATAAGCACTGAACCCTTACTGCTTCAAACTCCTCCTCCCATTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765398.1
MGILQSSCRAKEEEDEIPIYPDFQNHYISWSPKLLKLSILIYKALKGILRKIGSIFSDAEPLLPVPNPASRGISTEPLLLQTPPPISDDEDLECDEENYLLGSAEEETVVVEIKTSFIQERWIKHYSSGHRILLVGEGNFSFSACLALAFHSAPNIIATSLDSRAFLEKHYDKALSNIEELRSRGSKVMHKINATTMANHQLLAHLKFDRIIFNFPYVGLKGFKNLPRQSQLACQQKLVRQFLENAREMIKENGEIHITH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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