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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001455`

染色体: Chr05 坐标: 13287619-13292532 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001455`
名称	SmilChr05G001455
描述	uncharacterized SmilChr05G001455
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13287619 - 13292532 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986142`
GeneID	`130986142`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986142`
原始查询	`LOC130986142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841230]; symbol=AT1G48120; hit=AT1G48120; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841230]; symbol=AT1G48120; hit=AT1G48120; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G48120` (AT1G48120) serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841230] identity=47.9; qcov=0.469; evalue=3.47e-132; confidence=medium
Rice	`Os02g0592600` - identity=40.1; qcov=0.403; evalue=2.05e-69; confidence=low
GO	GO:0010073 (meristem maintenance); GO:0048507 (meristem development)
KEGG	-
Pfam	PF10536 (PMD); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986142

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765409.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057765409.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765409.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765409.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765409.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13288908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:13289032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B104,B2,D1
`Chr5:13289092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13289137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr5:13289203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B8,C15,C20,D10
`Chr5:13289783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13289800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:13290186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C28,C29,C33
`Chr5:13290187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:13290193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D6
`Chr5:13290287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:13290323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B8,C15,C20,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765409.1

971 aa

486

971

DUF8566

PMD

PF29561 DUF8566 4-194 aa PF10536 PMD 6-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765409.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	4	194	2.8e-12	47.6	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057765409.1`	Pfam	`PF10536`	PMD	Domain	6	380	8.5e-97	325.1	Plant mobile domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909426.1
TTTCGGTTTTCTGGATTTTCTCTTTCTGGGTGTCGGCTGGTGGCCCTCTGTTGCCTATTTATTGAGCGAGAGACTGATCATCATAGATCTACAGAGATATGGAATGGTCAGAATTTTGAACCACTAACTTGCAGGAGGTGCGATGGCCACTTTTGGCGATTGGGTACCTTGGACCCTCGAGTGCAGGAAATGATGTTGAAAGCAGGTTTTTATGGGGTGTATAAGGCTGGTCGCATGCGGCTGGATCATGCTTTAATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986142
ATGATGTTGAAAGCAGGTTTTTATGGGGTGTATAAGGCTGGTCGCATGCGGCTGGATCATGCTTTAATCACAGCTTTGGTTGAGAGATGGCGCCCTGAGACACATACTTTCCATTTGCCAGTTGGTGAGACCACTGTTACACTTCAGGACATTTCCGTATTGTGGGGTCTCCCTGTAGATGGTGAGCCTATTACAGGTGTTGATACCAACCGGTCAATGGATGAATGGCAAGACATATGCAATGAGCTATTGGGATTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765409.1
MMLKAGFYGVYKAGRMRLDHALITALVERWRPETHTFHLPVGETTVTLQDISVLWGLPVDGEPITGVDTNRSMDEWQDICNELLGFRPPPEDFDRGRLKIRCLQERFKTLPDGASECTVQFYARAYILQLLGGQLLSDMSNNKVKLMYLPLLRDFEVAGKLSWGGAVLSCLYRALCRATKPETSDICGPLVLLQIWAWERLPFIRPGRLAPRQQPPPDVVAGDHPLPSAPYGSRWNVGFKLETVGTHVLVLYRDQLDNMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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