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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001473`

染色体: Chr05 坐标: 13502916-13505591 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001473`
名称	SmilChr05G001473
描述	uncharacterized SmilChr05G001473
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13502916 - 13505591 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986164`
GeneID	`130986164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986164`
原始查询	`LOC130986164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717365]; symbol=AT1G55865; hit=AT1G55865; species=arabidopsis; confidence=low
产物	ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717365]; symbol=AT1G55865; hit=AT1G55865; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G55865` (AT1G55865) ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717365] identity=44.6; qcov=0.722; evalue=3.46e-13; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765452.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765454.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765459.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057765450.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765452.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13503622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:13503630`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	159	A1,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A6,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B12,B121,B122,B123,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B139,B140,B15,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B32,B34,B36,B37,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B6,B60,B61,B64,B65,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B86,B90,B92,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C15,C17,C2,C20,C21,C23,C27,C3,C30,C31,C32,C34,C36,C37,C39,C4,C40,C43,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C72,C74,C78,C82,C83,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6
`Chr5:13503664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,B8
`Chr5:13503677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B50,B53,C32,C68,D4
`Chr5:13503704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B80
`Chr5:13503747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C23,C67
`Chr5:13503769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B80
`Chr5:13503806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B16,B69,C30
`Chr5:13503811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C60
`Chr5:13503811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:13503861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:13503875`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A10,A15,A16,A18,A19,A22,A23,B1,B103,B106,B109,B110,B111,B112,B115,B117,B120,B124,B125,B126,B13,B137,B138,B16,B2,B22,B23,B26,B28,B29,B3,B30,B36,B38,B39,B4,B44,B50,B51,B52,B53,B56,B58,B59,B6,B62,B64,B65,B66,B7,B74,B75,B76,B8,B81,B84,B85,B9,B91,B94,B96,C16,C18,C25,C27,C37,C38,C39,C58,C63,C75,C78,C79,C8,C85,C9,D1,D2,D3,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

16 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089188.1
TTCCTTTTCAATCCGCCGTAAAACCTTGGAGAATCAATGGGTTGCTCCGGTGTTCCGACAGCAGTGTTTACTGAGACAAACCTGGGCACCTGCCTCGCCGTTCCGGCTTCTCCGGACATCACGGCCGACGACTTCAAGAGAGAGGTGGAAAGGGCGCATCTCAATTGTTTCCCCGAATTCGGAACTATCAGGGTCAAAGCAGTGATGACCAGGTGACGCAAAAATTACAACGTTATCACTTATCGGGGTCTTTGCCTCTC...

XR_009089194.1
TTCCTTTTCAATCCGCCGTAAAACCTTGGAGAATCAATGGGTTGCTCCGGTGTTCCGACAGCAGTGTTTACTGAGACAAACCTGGGCACCTGCCTCGCCGTTCCGGCTTCTCCGGACATCACGGCCGACGACTTCAAGAGAGAGGTGGAAAGGGCGCATCTCAATTGTTTCCCCGAATTCGGAACTATCAGGGTCAAAGCAGTGATGGTATGTTTTTGCTAGTCACTGAGACACAATGGAGCCGAAGTTTGCAATCTGAA...

CDS

10 records

下载 CDS FASTA

LOC130986164
ATGGGTTGCTCCGGTGTTCCGACAGCAGTGTTTACTGAGACAAACCTGGGCACCTGCCTCGCCGTTCCGGCTTCTCCGGACATCACGGCCGACGACTTCAAGAGAGAGGTGGAAAGGGCGCATCTCAATTGTTTCCCCGAATTCGGAACTATCAGGGTCAAAGCAGTGATGGTGACGCAAAAATTACAACGTTATCACTTATCGGGGTCTTTGCCTCTCAAGTATGCTTTTCTGGGTTCAAATGTTACTTGGTTTCTTCA...

LOC130986164
ATGGGTTGCTCCGGTGTTCCGACAGCAGTGTTTACTGAGACAAACCTGGGCACCTGCCTCGCCGTTCCGGCTTCTCCGGACATCACGGCCGACGACTTCAAGAGAGAGGTGGAAAGGGCGCATCTCAATTGTTTCCCCGAATTCGGAACTATCAGGGTCAAAGCAGTGATGGTTATCACTTATCGGGGTCTTTGCCTCTCAAAGTCACTGAGACACAATGGAGCCGAAGTTTGCAATCTGAATTCTGCTGCTGATGTGAT...

Protein

10 records

下载 Protein FASTA

XP_057765450.1
MGCSGVPTAVFTETNLGTCLAVPASPDITADDFKIGCTISRSRFTHIYICESLNGRGGKGASQLFPRIRNYQGQSSDDQVTQKLQRYHLSGSLPLKYAFLGSNVTWFLQTHVILSNVPTHVESLRHNGAEVCNLNSAADVITNLVELGSASPEKRTKCKRKIKVGRFLKISTALCFRRKWKRKNAKKSLKRDTQY

XP_057765451.1
MGCSGVPTAVFTETNLGTCLAVPASPDITADDFKIGCTISRSRFTHIYICESLNGRGGKGASQLFPRIRNYQGQSSDGYHLSGSLPLKYAFLGSNVTWFLQTHVILSNVPTHVESLRHNGAEVCNLNSAADVITNLVELGSASPEKRTKCKRKIKVGRFLKISTALCFRRKWKRKNAKKSLKRDTQY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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