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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001478`

染色体: Chr05 坐标: 13556417-13563119 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001478`
名称	SmilChr05G001478
描述	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13556417 - 13563119 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986170`
GeneID	`130986170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986170`
原始查询	`LOC130986170`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial-like
产物	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G04540` (AT2G04540) Beta-ketoacyl synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814996] identity=72.7; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0196900` - identity=77.5; qcov=0.503; evalue=1.73e-131; confidence=medium
GO	GO:0004315 (3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity); GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00780 (Biotin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00109 (ketoacyl-synt); PF02801 (Ketoacyl-synt_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057765464.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057765464.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765464.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765464.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765464.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13557102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B2,B35,C71,D1
`Chr5:13559583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13559634`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A10,A16,A22,B103,B106,B110,B111,B117,B124,B125,B126,B16,B23,B26,B28,B30,B38,B39,B50,B51,B52,B53,B6,B62,B66,B8,B81,B88,B9,B96,C16,C18,C25,C27,C28,C29,C33,C39,C63,C78,C79,C8,C85
`Chr5:13560124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B113,B139,B58,C76
`Chr5:13560181`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A16
`Chr5:13560181`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A16
`Chr5:13560247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B113,B139,B58,C76
`Chr5:13561048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B58,B74,C58,C75
`Chr5:13561049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:13561259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765464.1

469 aa

234

469

ketoacyl-synt

Ketoacyl-synt_C

PF00109 ketoacyl-synt 35-300 aa PF02801 Ketoacyl-synt_C 308-424 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765464.1`	Pfam	`PF00109`	ketoacyl-synt	Domain	35	300	6.2e-55	187.2	Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain
`XP_057765464.1`	Pfam	`PF02801`	Ketoacyl-synt_C	Domain	308	424	9.7e-38	129.5	Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089195.1
AGAATTTTATTGAGTAATTGATGTAGTTTAATTTCAATACTTGTGATGTTCTAGTTTAGTTAAAGAATCAGTCTCACTCACGACGCTGCCACCCGTTACCCATCCTAACCCGCCGCCCCGCACCGTACCGTCCAGCCTCGCAACGGACGGCCCGGACCTTGCCTCTCTGTCACTCAGCAACTGCTCCGCCCGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCCACCCCGCGACCACCCCTCGCCGCCGCGCCAACGGCCGCCTCCGGCGTC...

XR_009089197.1
AGAATTTTATTGAGTAATTGATGTAGTTTAATTTCAATACTTGTGATGTTCTAGTTTAGTTAAAGAATCAGTCTCACTCACGACGCTGCCACCCGTTACCCATCCTAACCCGCCGCCCCGCACCGTACCGTCCAGCCTCGCAACGGACGGCCCGGACCTTGCCTCTCTGTCACTCAGCAACTGCTCCGCCCGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCCACCCCGCGACCACCCCTCGCCGCCGCGCCAACGGCCGCCTCCGGCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986170
ATGGCAATGGCTAAGCACAATAAGAGAATCTTGACATCAATCATTCACGTCAGCCGTTTGTTCTCTACTGTTCCCTTTGACCCTCCACCCCTTTCAGCGTCTCGTCGAGTTGTTGTGACAGGTTTAGGGATGGTAACTCCTTTGGGCTGTGGTGTGGAAACTACCTGGAAGCATTTAATGGATGGGGATTGCGGAATTAGGGCAGCAACTATTGAAGATCTGAAGATGAATGGATTTGATACGGAGACAAAACAGCAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765464.1
MAMAKHNKRILTSIIHVSRLFSTVPFDPPPLSASRRVVVTGLGMVTPLGCGVETTWKHLMDGDCGIRAATIEDLKMNGFDTETKQQTFDQLTSKVAGVVRCGSNPGEFNEELWLNSKDHRSIARFIGYALCASDEALRDANYIPTQQDEKESTGVSIGAGTGSISDILDASRMICEKKLRRLSPFFIPRILINMASGHVSMKYGFQGPNHAAVTACATGAHSIGDATRMIQFGDADVMVAGGTEASIDALSIAGFCRSRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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