当前解析结果
SmilChr01G002729| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002729 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002729 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002729 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 45633383 - 45635183 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986189 |
|---|---|
| GeneID | 130986189 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986189 |
| 原始查询 | LOC130986189 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0597300- identity=47.4; qcov=0.298; evalue=4.17e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986189 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057765491.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765491.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765491.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057765491.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057765491.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:45634316 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B68,B98,C86 |
Chr1:45634345 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,B66 |
Chr1:45634348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B101,D11 |
Chr1:45634392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,B11,C14 |
Chr1:45634488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:45634675 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A23,C68 |
Chr1:45634675 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A23,C68 |
Chr1:45634677 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B125,B21,B81,C15,C50,C85 |
Chr1:45634700 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B65 |
Chr1:45634700 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr1:45634701 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B132,B72,C33,C46,C65 |
Chr1:45634701 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 5 | B132,B72,C33,C46,C65 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。