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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001500`

染色体: Chr05 坐标: 13761609-13764126 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001500`
名称	SmilChr05G001500
描述	probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13761609 - 13764126 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986193`
GeneID	`130986193`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986193`
原始查询	`LOC130986193`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 1
产物	probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 1
Arabidopsis	`AT5G54500` (FQR1) flavodoxin-like quinone reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835538] identity=85.9; qcov=0.978; evalue=1.73e-85; confidence=high
Rice	`Os08g0139200` - identity=84.4; qcov=0.978; evalue=7.53e-82; confidence=high
GO	GO:0003955 (NAD(P)H dehydrogenase (quinone) activity); GO:0010181 (FMN binding)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00258 (Flavodoxin_1); PF03358 (FMN_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986193

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765492.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765492.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765492.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765492.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765492.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13762238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A7,B135,B40,B82
`Chr5:13762252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A10,B114,B137,B2,B31,B32,B55,C23,C28,C34,C39,C57,C7,C71,C81,C86
`Chr5:13762476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A3,A7,B135,B40,B82,C49,D11
`Chr5:13762505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr5:13762506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B66,C79,C81,D5
`Chr5:13762514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B12,B139
`Chr5:13762544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:13762560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:13762609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B91,D2
`Chr5:13762638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C77
`Chr5:13762656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr5:13762689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765492.1

138 aa

138

Flavodoxin_1

FMN_red

PF00258 Flavodoxin_1 1-131 aa PF03358 FMN_red 10-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765492.1`	Pfam	`PF00258`	Flavodoxin_1	Domain	1	131	1.8e-10	41.9	Flavodoxin
`XP_057765492.1`	Pfam	`PF03358`	FMN_red	Domain	10	132	7e-14	52.4	NADPH-dependent FMN reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089207.1
TTATCCTTCGTCCTTAGCGAACAAACGATGTTCATTCTCTAAAATTCCCTTCGTCCTTAGCAAACCCTAGTCTGAAATTGCCACACCTCCGACCATCGCCGCATCCTTCTCCATTGTGACCACCGCCGCACCTCCGACCACCACCGCACCTCCGACGACGCGATTTCAACCACCGGCTTTTGACGACGACTCTGGAGCAACATTCACGCCGGAGCTTCTCTCATTCTGCTGCCTCAGACGACGCGAGTTCCCCGCTGTCA...

XR_009089206.1
TTATCCTTCGTCCTTAGCGAACAAACGATGTTCATTCTCTAAAATTCCCTTCGTCCTTAGCAAACCCTAGTCTGAAATTGCCACACCTCCGACCATCGCCGCATCCTTCTCCATTGTGACCACCGCCGCACCTCCGACCACCACCGCACCTCCGACGACGCGATTTCAACCACCGGCTTTTGACGACGACTCTGGAGCAACATTCACGCCGGAGCTTCTCTCATTCTGCTGCCTCAGACGACGCGAGTTCCCCGCTGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986193
ATGTACTATTCTATGTATGGACATGTGGAGAAACTAGCTGAAGAGATAAAGAAGGGAGCTGCATCTGTTGAAGGAGTAGAAGCCCAGCTATGGCAGGTCCCGGAAACACTATCTGATGAAGTTCTCACAAAAATGAGTGTGCCTCCAAAGAGTGATGTGCCCATTATCACTCCTAATCAACTCTCGGAGGCTGACGGTTTCATATTCGGCTTCCCTACAAGGTTCGGCATGATGGCTGCACAATTCAAAGCATTTTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765492.1
MYYSMYGHVEKLAEEIKKGAASVEGVEAQLWQVPETLSDEVLTKMSVPPKSDVPIITPNQLSEADGFIFGFPTRFGMMAAQFKAFFDATGGLWKAQQLAGKPAGIFYSTGSQGGGQETTALTAITQLVHHGMILLIDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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