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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001513`

染色体: Chr05 坐标: 13878912-13883130 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001513`
名称	SmilChr05G001513
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 18-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13878912 - 13883130 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986205`
GeneID	`130986205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986205`
原始查询	`LOC130986205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 18-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 18-like
Arabidopsis	`AT2G05160` (AT2G05160) CCCH-type zinc fingerfamily protein with RNA-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815064] identity=44.8; qcov=1.03; evalue=4.99e-143; confidence=medium
Rice	`Os08g0126700` (OsC3H54) - identity=40.4; qcov=1.13; evalue=1.12e-117; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF23182 (PABC_AtC3H46)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765503.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765503.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765503.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057765503.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057765503.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13880299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B29,B67,C51
`Chr5:13880483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B139,C17,C75
`Chr5:13880841`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr5:13880841`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr5:13880852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr5:13880893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:13881048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B103,C37
`Chr5:13881087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C64,C66
`Chr5:13881315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:13881431`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A10
`Chr5:13881431`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A10
`Chr5:13882681`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B14,B16,B34,B36,B63,B76,B92,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765503.1

565 aa

282

565

PABC_AtC3H46

RRM_1

PF23182 PABC_AtC3H46 1-62 aa PF00076 RRM_1 352-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765503.1`	Pfam	`PF23182`	PABC_AtC3H46	Domain	1	62	8.8e-27	93.8	AtC3H46 PABC domain
`XP_057765503.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	352	400	9e-07	29.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909520.1
GATAGCTGTGAGTTATTGAGGGAAAAAAATCCGCCATGGTTTGCAAATTGATTATCAGGGATAAGCATTATCTATTTATTTATTTAGGAAATGGTTTTAAAATAAATTATAAGCAATATATAAATGTGAAACTGCCAAAATACTGCAGTGAAGACGCATAGTGCCCCCTATAAAGCCAATATTTCTTGTCATTTTGCTTTGCGAAAGGAAGATGGCGTTGGCTTCTGTATGCTGAGAAGTTTCGGCACATAAAGTTAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986205
ATGGATTCTTCTGAGGCTACAAAGGTTGTAATCGAGAGAATTTCGAGGCTGGAACCCGAGCATGTTGCAAAGAAGATAATCGGATACATGTATTTTCAAGGCCTTTCTGACCAAGAAATGATTAGATTAGCCTTAGGCCCTGATAGCTTAATCCATAACTTGATACAGAAAGCTAAAACTGCACGTTTATTAGCCCCATCACAAGTTATTTCACCTCCAATTTCCCCCACCATGAATCCACCCTCTTTATCAGATCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765503.1
MDSSEATKVVIERISRLEPEHVAKKIIGYMYFQGLSDQEMIRLALGPDSLIHNLIQKAKTARLLAPSQVISPPISPTMNPPSLSDPSFQFAPFQSVSPRPFPSPTAFRRMDPYWDAQLPVEQPTMQNAPLKLMPYSDYIGFEDTLDVGKPGASSFPNDYYCPEAALNSLSTRGARSSSNLMAFPVKTCHYFIKGFCKHGNNCRYYHGESFPETLPHAFGLSSYDVAGDEGFLPGSLEKLELEITELLKSRRGHPVSIASL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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